RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000073128.6

Sh3bp5l-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp5l, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 NischQ80TM9 1593 aa24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Abcc9P70170 1546 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Rtl1Q7M732 1744 aa22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Rhox8Q6VSS7 320 aa22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Dcaf1Q80TR8 1506 aa21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 ScribQ80U72 1612 aa21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Baz1aO88379 1555 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Kdm5dQ62240 1548 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 HrcG5E8J6 738 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 NacadQ5SWP3 1504 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Crybg2B7ZCC2 1516 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Trim41Q5NCC3 630 aa20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Sycp2Q9CUU3 1500 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cep164Q5DU05 1446 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 BicraF8VPZ9 1578 aa19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Golga3P55937 1487 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Synj1Q8CHC4 1574 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Chic1Q8CBW7 227 aa19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cngb1E1AZ71 1325 aa19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Pcgf6Q99NA9 353 aa19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Top2bQ64511 1612 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 CftrP26361 1476 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Gab3Q8BSM5 595 aa19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Fmn1Q05860 1466 aa19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 NefmP08553 848 aa19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Mier1Q5UAK0 511 aa19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Neurod1Q60867 357 aa19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cep162Q6ZQ06 1403 aa19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Zeb1Q64318 1117 aa19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 TnnQ80Z71 1560 aa19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 UbtfP25976 765 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Sall2Q9QX96 1004 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Myt1lP97500 1187 aa18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Npm2Q80W85 207 aa18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Wdr62Q3U3T8 1523 aa18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Lamc3Q9R0B6 1581 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Clip1Q922J3 1391 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Frmpd1A2AKB4 1549 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 NrkQ9R0G8 1455 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Arhgap35Q91YM2 1499 aa18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Unc13aQ4KUS2 1712 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 PtprkP35822 1457 aa18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ercc6F8VPZ5 1481 aa18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Csrnp3P59055 597 aa18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Shroom4Q1W617 1475 aa18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Camsap1A2AHC3 1581 aa18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Map3k1P53349 1493 aa18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Eea1Q8BL66 1411 aa18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Arap1Q4LDD4 1452 aa18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ccdc18Q640L5 1455 aa18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 ClspnQ80YR7 1315 aa18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 TonslQ6NZL6 1363 aa18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Kif15Q6P9L6 1387 aa18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Wdr66E9Q743 1299 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Erich3F6QRE9 1637 aa18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Anks4bQ8K3X6 423 aa18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Grin2bQ01097 1482 aa18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Kdm5bQ80Y84 1544 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Tiam1Q60610 1591 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Setd5Q5XJV7 1441 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Gm38655A0A286YDK6 273 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ankrd26Q811D2 1581 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Il27Q8K3I6 234 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 CenpbP27790 599 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 304.7 ms