RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038791.14

Gde1-201, Transcript of Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gde1, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa30.77■■■□□ 2.52
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Crybg2B7ZCC2 1516 aa30.09■■■□□ 2.41
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28.62■■■□□ 2.17
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Unc13aQ4KUS2 1712 aa28.36■■■□□ 2.13
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Golga3P55937 1487 aa27.82■■■□□ 2.04
Gde1-201ENSMUST00000038791 Top2bQ64511 1612 aa27.81■■■□□ 2.04
Gde1-201ENSMUST00000038791 Mrc2Q64449 1479 aa27.77■■■□□ 2.04
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Lamc3Q9R0B6 1581 aa27.73■■■□□ 2.03
Gde1-201ENSMUST00000038791 Kif15Q6P9L6 1387 aa27.67■■■□□ 2.02
Gde1-201ENSMUST00000038791 Cngb1E1AZ71 1325 aa27.6■■■□□ 2.01
Gde1-201ENSMUST00000038791 TnnQ80Z71 1560 aa27.6■■■□□ 2.01
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Kif21aQ9QXL2 1672 aa27.37■■□□□ 1.97
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Grin2bQ01097 1482 aa26.93■■□□□ 1.9
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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Gde1-201ENSMUST00000038791 NrkQ9R0G8 1455 aa26.71■■□□□ 1.87
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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Gde1-201ENSMUST00000038791 SynmQ70IV5 1561 aa26.38■■□□□ 1.81
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa26.28■■□□□ 1.8
Gde1-201ENSMUST00000038791 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
Gde1-201ENSMUST00000038791 Arhgap35Q91YM2 1499 aa26.23■■□□□ 1.79
Gde1-201ENSMUST00000038791 Npm2Q80W85 207 aa26.23■■□□□ 1.79
Gde1-201ENSMUST00000038791 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
Gde1-201ENSMUST00000038791 Shroom2A2ALU4 1481 aa26.18■■□□□ 1.78
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Map3k1P53349 1493 aa26.14■■□□□ 1.78
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