RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035673.7

Vhl-201, Transcript of von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vhl, Length 2,792 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vhl-201ENSMUST00000035673 NischQ80TM9 1593 aa35.67■■■■□ 3.3
Vhl-201ENSMUST00000035673 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa35.38■■■■□ 3.25
Vhl-201ENSMUST00000035673 Abcc9P70170 1546 aa34.6■■■■□ 3.13
Vhl-201ENSMUST00000035673 Abcc8B2RUS7 1588 aa34.04■■■■□ 3.04
Vhl-201ENSMUST00000035673 Rhox8Q6VSS7 320 aa32.41■■■□□ 2.78
Vhl-201ENSMUST00000035673 ScribQ80U72 1612 aa32.05■■■□□ 2.72
Vhl-201ENSMUST00000035673 Dcaf1Q80TR8 1506 aa31.62■■■□□ 2.65
Vhl-201ENSMUST00000035673 Rtl1Q7M732 1744 aa31.41■■■□□ 2.62
Vhl-201ENSMUST00000035673 Kdm5dQ62240 1548 aa31.31■■■□□ 2.6
Vhl-201ENSMUST00000035673 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.21■■■□□ 2.59
Vhl-201ENSMUST00000035673 NacadQ5SWP3 1504 aa31.15■■■□□ 2.58
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ccdc180J3QNE4 1664 aa30.85■■■□□ 2.53
Vhl-201ENSMUST00000035673 Baz1aO88379 1555 aa30.82■■■□□ 2.52
Vhl-201ENSMUST00000035673 Sycp2Q9CUU3 1500 aa30.49■■■□□ 2.47
Vhl-201ENSMUST00000035673 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
Vhl-201ENSMUST00000035673 Crybg2B7ZCC2 1516 aa30.37■■■□□ 2.45
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa30.15■■■□□ 2.42
Vhl-201ENSMUST00000035673 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.07■■■□□ 2.4
Vhl-201ENSMUST00000035673 BicraF8VPZ9 1578 aa29.9■■■□□ 2.38
Vhl-201ENSMUST00000035673 Trim41Q5NCC3 630 aa29.56■■■□□ 2.32
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa29.51■■■□□ 2.32
Vhl-201ENSMUST00000035673 HrcG5E8J6 738 aa29.33■■■□□ 2.29
Vhl-201ENSMUST00000035673 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
Vhl-201ENSMUST00000035673 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.15■■■□□ 2.26
Vhl-201ENSMUST00000035673 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
Vhl-201ENSMUST00000035673 CftrP26361 1476 aa29.02■■■□□ 2.24
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa28.92■■■□□ 2.22
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.88■■■□□ 2.21
Vhl-201ENSMUST00000035673 Golga3P55937 1487 aa28.81■■■□□ 2.2
Vhl-201ENSMUST00000035673 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Vhl-201ENSMUST00000035673 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa28.73■■■□□ 2.19
Vhl-201ENSMUST00000035673 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
Vhl-201ENSMUST00000035673 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cep164Q5DU05 1446 aa28.68■■■□□ 2.18
Vhl-201ENSMUST00000035673 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Vhl-201ENSMUST00000035673 Top2bQ64511 1612 aa28.58■■■□□ 2.17
Vhl-201ENSMUST00000035673 Chic1Q8CBW7 227 aa28.56■■■□□ 2.16
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa28.51■■■□□ 2.15
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28.34■■■□□ 2.13
Vhl-201ENSMUST00000035673 Frmpd1A2AKB4 1549 aa28.24■■■□□ 2.11
Vhl-201ENSMUST00000035673 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28.23■■■□□ 2.11
Vhl-201ENSMUST00000035673 Gab3Q8BSM5 595 aa28.2■■■□□ 2.11
Vhl-201ENSMUST00000035673 Fmn1Q05860 1466 aa28.17■■■□□ 2.1
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28.15■■■□□ 2.1
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
Vhl-201ENSMUST00000035673 Unc13aQ4KUS2 1712 aa27.96■■■□□ 2.07
Vhl-201ENSMUST00000035673 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
Vhl-201ENSMUST00000035673 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
Vhl-201ENSMUST00000035673 TnnQ80Z71 1560 aa27.9■■■□□ 2.06
Vhl-201ENSMUST00000035673 Lamc3Q9R0B6 1581 aa27.81■■■□□ 2.04
Vhl-201ENSMUST00000035673 Kif15Q6P9L6 1387 aa27.74■■■□□ 2.03
Vhl-201ENSMUST00000035673 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
Vhl-201ENSMUST00000035673 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa27.7■■■□□ 2.03
Vhl-201ENSMUST00000035673 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Vhl-201ENSMUST00000035673 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.56■■■□□ 2
Vhl-201ENSMUST00000035673 Fam135aQ6NS59 1506 aa27.55■■■□□ 2
Vhl-201ENSMUST00000035673 Il27Q8K3I6 234 aa27.54■■■□□ 2
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ubl4bQ9CQ84 188 aa27.53■■■□□ 2
Vhl-201ENSMUST00000035673 Camsap1A2AHC3 1581 aa27.51■■□□□ 1.99
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cep162Q6ZQ06 1403 aa27.49■■□□□ 1.99
Vhl-201ENSMUST00000035673 Npm2Q80W85 207 aa27.48■■□□□ 1.99
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.42■■□□□ 1.98
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cux2P70298 1426 aa27.4■■□□□ 1.98
Vhl-201ENSMUST00000035673 Myt1lP97500 1187 aa27.36■■□□□ 1.97
Vhl-201ENSMUST00000035673 PtprkP35822 1457 aa27.36■■□□□ 1.97
Vhl-201ENSMUST00000035673 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Vhl-201ENSMUST00000035673 NrkQ9R0G8 1455 aa27.28■■□□□ 1.96
Vhl-201ENSMUST00000035673 Grin2bQ01097 1482 aa27.27■■□□□ 1.96
Vhl-201ENSMUST00000035673 Shroom4Q1W617 1475 aa27.26■■□□□ 1.95
Vhl-201ENSMUST00000035673 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Vhl-201ENSMUST00000035673 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa27.22■■□□□ 1.95
Vhl-201ENSMUST00000035673 Arhgap35Q91YM2 1499 aa27.2■■□□□ 1.95
Vhl-201ENSMUST00000035673 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
Vhl-201ENSMUST00000035673 Baz1bQ9Z277 1479 aa27.03■■□□□ 1.92
Vhl-201ENSMUST00000035673 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Zeb1Q64318 1117 aa27.01■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Map3k1P53349 1493 aa27■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Efcab5A0JP43 1406 aa26.98■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Mrc2Q64449 1479 aa26.98■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Clip1Q922J3 1391 aa26.98■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa26.98■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Duox2A2AQ99 1517 aa26.97■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Vhl-201ENSMUST00000035673 Kif21aQ9QXL2 1672 aa26.87■■□□□ 1.89
Vhl-201ENSMUST00000035673 Eea1Q8BL66 1411 aa26.83■■□□□ 1.89
Vhl-201ENSMUST00000035673 UbtfP25976 765 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Vhl-201ENSMUST00000035673 Mier1Q5UAK0 511 aa26.8■■□□□ 1.88
Vhl-201ENSMUST00000035673 Samd9lQ69Z37 1561 aa26.79■■□□□ 1.88
Vhl-201ENSMUST00000035673 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Vhl-201ENSMUST00000035673 Crocc2F6XLV1 1638 aa26.77■■□□□ 1.88
Vhl-201ENSMUST00000035673 Setd5Q5XJV7 1441 aa26.76■■□□□ 1.87
Vhl-201ENSMUST00000035673 Arap1Q4LDD4 1452 aa26.75■■□□□ 1.87
Vhl-201ENSMUST00000035673 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa26.74■■□□□ 1.87
Vhl-201ENSMUST00000035673 Carmil1Q6EDY6 1374 aa26.7■■□□□ 1.86
Vhl-201ENSMUST00000035673 SynmQ70IV5 1561 aa26.7■■□□□ 1.86
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa26.69■■□□□ 1.86
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ankrd26Q811D2 1581 aa26.67■■□□□ 1.86
Vhl-201ENSMUST00000035673 Rad54l2Q99NG0 1466 aa26.65■■□□□ 1.86
Vhl-201ENSMUST00000035673 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa26.65■■□□□ 1.86
Vhl-201ENSMUST00000035673 Erich3F6QRE9 1637 aa26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 429.3 ms