RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034015.10

Msmo1-201, Transcript of Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msmo1, Length 2,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1-201ENSMUST00000034015 NischQ80TM9 1593 aa33.8■■■■□ 3
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Abcc8B2RUS7 1588 aa32.17■■■□□ 2.74
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Rhox8Q6VSS7 320 aa30.8■■■□□ 2.52
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Rtl1Q7M732 1744 aa30.58■■■□□ 2.49
Msmo1-201ENSMUST00000034015 ScribQ80U72 1612 aa30.12■■■□□ 2.41
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Dcaf1Q80TR8 1506 aa30.11■■■□□ 2.41
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.83■■■□□ 2.37
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa29.62■■■□□ 2.33
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Kdm5dQ62240 1548 aa29.51■■■□□ 2.31
Msmo1-201ENSMUST00000034015 NacadQ5SWP3 1504 aa29.36■■■□□ 2.29
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Baz1aO88379 1555 aa29.29■■■□□ 2.28
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Crybg2B7ZCC2 1516 aa28.89■■■□□ 2.22
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Sycp2Q9CUU3 1500 aa28.71■■■□□ 2.19
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Smarca2Q6DIC0 1577 aa28.6■■■□□ 2.17
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28.55■■■□□ 2.16
Msmo1-201ENSMUST00000034015 HrcG5E8J6 738 aa28.33■■■□□ 2.13
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Trim41Q5NCC3 630 aa28.18■■■□□ 2.1
Msmo1-201ENSMUST00000034015 BicraF8VPZ9 1578 aa28.05■■■□□ 2.08
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Synj1Q8CHC4 1574 aa27.63■■■□□ 2.01
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa27.47■■□□□ 1.99
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Golga3P55937 1487 aa27.46■■□□□ 1.99
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.45■■□□□ 1.99
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Top2bQ64511 1612 aa27.26■■□□□ 1.95
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa27.14■■□□□ 1.93
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa27.09■■□□□ 1.93
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.95■■□□□ 1.9
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Fmn1Q05860 1466 aa26.85■■□□□ 1.89
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Gab3Q8BSM5 595 aa26.82■■□□□ 1.88
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Wdr62Q3U3T8 1523 aa26.58■■□□□ 1.85
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Frmpd1A2AKB4 1549 aa26.53■■□□□ 1.84
Msmo1-201ENSMUST00000034015 TnnQ80Z71 1560 aa26.52■■□□□ 1.84
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.52■■□□□ 1.84
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ercc6F8VPZ5 1481 aa26.46■■□□□ 1.83
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Lamc3Q9R0B6 1581 aa26.34■■□□□ 1.81
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Unc13aQ4KUS2 1712 aa26.33■■□□□ 1.8
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Cep162Q6ZQ06 1403 aa26.26■■□□□ 1.79
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Kif15Q6P9L6 1387 aa26.13■■□□□ 1.77
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Npm2Q80W85 207 aa26.1■■□□□ 1.77
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Camsap1A2AHC3 1581 aa26.07■■□□□ 1.76
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 NrkQ9R0G8 1455 aa25.99■■□□□ 1.75
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Myt1lP97500 1187 aa25.98■■□□□ 1.75
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.97■■□□□ 1.75
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Shroom4Q1W617 1475 aa25.92■■□□□ 1.74
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Arhgap35Q91YM2 1499 aa25.91■■□□□ 1.74
Msmo1-201ENSMUST00000034015 PtprkP35822 1457 aa25.89■■□□□ 1.74
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Mier1Q5UAK0 511 aa25.87■■□□□ 1.73
Msmo1-201ENSMUST00000034015 NefmP08553 848 aa25.86■■□□□ 1.73
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Il27Q8K3I6 234 aa25.85■■□□□ 1.73
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Fam135aQ6NS59 1506 aa25.85■■□□□ 1.73
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Grin2bQ01097 1482 aa25.84■■□□□ 1.73
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Map3k1P53349 1493 aa25.82■■□□□ 1.72
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Clip1Q922J3 1391 aa25.79■■□□□ 1.72
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Cux2P70298 1426 aa25.75■■□□□ 1.71
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ubl4bQ9CQ84 188 aa25.72■■□□□ 1.71
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Eea1Q8BL66 1411 aa25.67■■□□□ 1.7
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa25.65■■□□□ 1.7
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Pcgf6Q99NA9 353 aa25.61■■□□□ 1.69
Msmo1-201ENSMUST00000034015 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Baz1bQ9Z277 1479 aa25.57■■□□□ 1.68
Msmo1-201ENSMUST00000034015 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Arap1Q4LDD4 1452 aa25.55■■□□□ 1.68
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Zeb1Q64318 1117 aa25.54■■□□□ 1.68
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Erich3F6QRE9 1637 aa25.52■■□□□ 1.68
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Msmo1-201ENSMUST00000034015 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa25.48■■□□□ 1.67
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Duox2A2AQ99 1517 aa25.46■■□□□ 1.67
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ankrd26Q811D2 1581 aa25.43■■□□□ 1.66
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Tiam1Q60610 1591 aa25.39■■□□□ 1.65
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Carmil1Q6EDY6 1374 aa25.39■■□□□ 1.65
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa25.38■■□□□ 1.65
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
Msmo1-201ENSMUST00000034015 SynmQ70IV5 1561 aa25.33■■□□□ 1.64
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Samd9lQ69Z37 1561 aa25.31■■□□□ 1.64
Msmo1-201ENSMUST00000034015 Pcf11G3X9Z4 1553 aa25.3■■□□□ 1.64
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