RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025271.16

Pou5f1-201, Transcript of POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pou5f1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa31.66■■■□□ 2.66
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Kdm5dQ62240 1548 aa28.31■■■□□ 2.12
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Shroom2A2ALU4 1481 aa25.18■■□□□ 1.62
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Cux2P70298 1426 aa25.05■■□□□ 1.6
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Col17a1Q07563 1470 aa25.02■■□□□ 1.6
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Kif21aQ9QXL2 1672 aa24.91■■□□□ 1.58
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Top2bQ64511 1612 aa24.72■■□□□ 1.55
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Il27Q8K3I6 234 aa24.34■■□□□ 1.49
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Ift140E9PY46 1464 aa24.24■■□□□ 1.47
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Crocc2F6XLV1 1638 aa24.23■■□□□ 1.47
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa24.23■■□□□ 1.47
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Camsap1A2AHC3 1581 aa24.2■■□□□ 1.46
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Fgd6Q69ZL1 1399 aa23.82■■□□□ 1.4
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Samd9lQ69Z37 1561 aa23.72■■□□□ 1.39
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Efcab5A0JP43 1406 aa23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Setd1bQ8CFT2 1985 aa23.66■■□□□ 1.38
Pou5f1-201ENSMUST00000025271 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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Pou5f1-201ENSMUST00000025271 NrkQ9R0G8 1455 aa23.58■■□□□ 1.37
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