RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023231.5

Tsta3-201, Transcript of GDP-L-fucose synthase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tsta3, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa28.97■■■□□ 2.23
Tsta3-201ENSMUST00000023231 NischQ80TM9 1593 aa28.43■■■□□ 2.14
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Abcc8B2RUS7 1588 aa27.54■■■□□ 2
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Abcc9P70170 1546 aa27.48■■□□□ 1.99
Tsta3-201ENSMUST00000023231 ScribQ80U72 1612 aa26.87■■□□□ 1.89
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Kdm5dQ62240 1548 aa25.86■■□□□ 1.73
Tsta3-201ENSMUST00000023231 NacadQ5SWP3 1504 aa25.83■■□□□ 1.72
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Sycp2Q9CUU3 1500 aa25.35■■□□□ 1.65
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Dcaf1Q80TR8 1506 aa25.24■■□□□ 1.63
Tsta3-201ENSMUST00000023231 BicraF8VPZ9 1578 aa25.14■■□□□ 1.61
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.88■■□□□ 1.57
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa24.83■■□□□ 1.57
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Baz1aO88379 1555 aa24.37■■□□□ 1.49
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.3■■□□□ 1.48
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.29■■□□□ 1.48
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.13■■□□□ 1.45
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa24.05■■□□□ 1.44
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Ercc6F8VPZ5 1481 aa23.94■■□□□ 1.42
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Smarca2Q6DIC0 1577 aa23.86■■□□□ 1.41
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa23.81■■□□□ 1.4
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Fam135aQ6NS59 1506 aa23.75■■□□□ 1.39
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.71■■□□□ 1.39
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Wdr62Q3U3T8 1523 aa23.61■■□□□ 1.37
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Frmpd1A2AKB4 1549 aa23.56■■□□□ 1.36
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Unc13aQ4KUS2 1712 aa23.46■■□□□ 1.35
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.25■■□□□ 1.31
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.24■■□□□ 1.31
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Rtl1Q7M732 1744 aa23.2■■□□□ 1.3
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Mrc2Q64449 1479 aa23.18■■□□□ 1.3
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.13■■□□□ 1.29
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.08■■□□□ 1.29
Tsta3-201ENSMUST00000023231 CftrP26361 1476 aa23.05■■□□□ 1.28
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Trim41Q5NCC3 630 aa22.88■■□□□ 1.25
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa22.84■■□□□ 1.25
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa22.8■■□□□ 1.24
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Kif21aQ9QXL2 1672 aa22.73■■□□□ 1.23
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Dnajc5P60904 198 aa22.71■■□□□ 1.23
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Cux2P70298 1426 aa22.66■■□□□ 1.22
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.62■■□□□ 1.21
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Lamc3Q9R0B6 1581 aa22.47■■□□□ 1.19
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Cep164Q5DU05 1446 aa22.26■■□□□ 1.15
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.23■■□□□ 1.15
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Il27Q8K3I6 234 aa22.19■■□□□ 1.14
Tsta3-201ENSMUST00000023231 TnnQ80Z71 1560 aa22.17■■□□□ 1.14
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.16■■□□□ 1.14
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Crocc2F6XLV1 1638 aa22.14■■□□□ 1.14
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.12■■□□□ 1.13
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.1■■□□□ 1.13
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Top2bQ64511 1612 aa22.1■■□□□ 1.13
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Col17a1Q07563 1470 aa22.02■■□□□ 1.12
Tsta3-201ENSMUST00000023231 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.01■■□□□ 1.11
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Rusc2Q80U22 1514 aa21.99■■□□□ 1.11
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Golga3P55937 1487 aa21.98■■□□□ 1.11
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Ift140E9PY46 1464 aa21.9■■□□□ 1.1
Tsta3-201ENSMUST00000023231 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Setd1bQ8CFT2 1985 aa21.87■■□□□ 1.09
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Duox2A2AQ99 1517 aa21.81■■□□□ 1.08
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Fmn1Q05860 1466 aa21.8■■□□□ 1.08
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Samd9lQ69Z37 1561 aa21.75■■□□□ 1.07
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Disp1Q3TDN0 1521 aa21.71■■□□□ 1.07
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Grin2bQ01097 1482 aa21.7■■□□□ 1.06
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Rad54l2Q99NG0 1466 aa21.56■■□□□ 1.04
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa21.55■■□□□ 1.04
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Grin2aP35436 1464 aa21.49■■□□□ 1.03
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Adgrl3Q80TS3 1537 aa21.49■■□□□ 1.03
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Cep170Q6A065 1588 aa21.48■■□□□ 1.03
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Magi3Q9EQJ9 1476 aa21.48■■□□□ 1.03
Tsta3-201ENSMUST00000023231 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Efcab5A0JP43 1406 aa21.46■■□□□ 1.03
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa21.45■■□□□ 1.02
Tsta3-201ENSMUST00000023231 PtprkP35822 1457 aa21.42■■□□□ 1.02
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa21.42■■□□□ 1.02
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa21.42■■□□□ 1.02
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.39■■□□□ 1.02
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa21.39■■□□□ 1.01
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.39■■□□□ 1.01
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Tsta3-201ENSMUST00000023231 AknaQ80VW7 1404 aa21.36■■□□□ 1.01
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Chd1P40201 1711 aa21.35■■□□□ 1.01
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Pla2r1Q62028 1487 aa21.33■■□□□ 1
Tsta3-201ENSMUST00000023231 Abcc1O35379 1528 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.4 ms