RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001548.13

Itga3-201, Transcript of Integrin alpha-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Itga3, Length 4,861 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3-201ENSMUST00000001548 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.58■■□□□ 1.36
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Cngb1E1AZ71 1325 aa23.1■■□□□ 1.29
Itga3-201ENSMUST00000001548 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
Itga3-201ENSMUST00000001548 CenpbP27790 599 aa21.89■■□□□ 1.09
Itga3-201ENSMUST00000001548 Myt1Q8CFC2 1127 aa21.89■■□□□ 1.09
Itga3-201ENSMUST00000001548 Amer1Q7TS75 1132 aa21.81■■□□□ 1.08
Itga3-201ENSMUST00000001548 Wdr66E9Q743 1299 aa21.6■■□□□ 1.05
Itga3-201ENSMUST00000001548 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
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Itga3-201ENSMUST00000001548 NefmP08553 848 aa20.81■□□□□ 0.92
Itga3-201ENSMUST00000001548 4933416C03RikQ3V063 378 aa20.7■□□□□ 0.9
Itga3-201ENSMUST00000001548 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa20.7■□□□□ 0.9
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Slc24a1Q91WD8 1130 aa20.16■□□□□ 0.82
Itga3-201ENSMUST00000001548 Trim41Q5NCC3 630 aa20.15■□□□□ 0.82
Itga3-201ENSMUST00000001548 HrcG5E8J6 738 aa20.11■□□□□ 0.81
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Anp32aO35381 247 aa19.91■□□□□ 0.78
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Myt1lP97500 1187 aa19.82■□□□□ 0.76
Itga3-201ENSMUST00000001548 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Itga3-201ENSMUST00000001548 DaxxO35613 739 aa19.79■□□□□ 0.76
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Aplp2Q06335 707 aa19.69■□□□□ 0.74
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Anks4bQ8K3X6 423 aa19.57■□□□□ 0.72
Itga3-201ENSMUST00000001548 Neurod1Q60867 357 aa19.53■□□□□ 0.72
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Csrnp3P59055 597 aa19.36■□□□□ 0.69
Itga3-201ENSMUST00000001548 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa19.33■□□□□ 0.68
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
Itga3-201ENSMUST00000001548 Lmod3E9QA62 571 aa19.01■□□□□ 0.63
Itga3-201ENSMUST00000001548 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa19■□□□□ 0.63
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Rtl1Q7M732 1744 aa18.97■□□□□ 0.63
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa18.95■□□□□ 0.62
Itga3-201ENSMUST00000001548 Trim44Q9QXA7 346 aa18.93■□□□□ 0.62
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Ccdc27Q3V036 639 aa18.89■□□□□ 0.62
Itga3-201ENSMUST00000001548 Irx3P81067 507 aa18.86■□□□□ 0.61
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Os9Q8K2C7 672 aa18.81■□□□□ 0.6
Itga3-201ENSMUST00000001548 ArxO35085 564 aa18.74■□□□□ 0.59
Itga3-201ENSMUST00000001548 Tnnt2P50752 301 aa18.7■□□□□ 0.58
Itga3-201ENSMUST00000001548 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa18.65■□□□□ 0.58
Itga3-201ENSMUST00000001548 AU015836B2RUM3 263 aa18.63■□□□□ 0.57
Itga3-201ENSMUST00000001548 Htatsf1Q8BGC0 757 aa18.63■□□□□ 0.57
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Nlrp6Q91WS2 869 aa18.51■□□□□ 0.55
Itga3-201ENSMUST00000001548 Dcaf1Q80TR8 1506 aa18.48■□□□□ 0.55
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Itga3-201ENSMUST00000001548 Pknox2Q8BG99 474 aa18.39■□□□□ 0.53
Itga3-201ENSMUST00000001548 Il27Q8K3I6 234 aa18.39■□□□□ 0.53
Itga3-201ENSMUST00000001548 Vsig10D3YX43 558 aa18.37■□□□□ 0.53
Itga3-201ENSMUST00000001548 Ccer2J3QPU5 274 aa18.36■□□□□ 0.53
Itga3-201ENSMUST00000001548 Mrs2Q5NCE8 434 aa18.33■□□□□ 0.53
Itga3-201ENSMUST00000001548 Abcc8B2RUS7 1588 aa18.32■□□□□ 0.52
Itga3-201ENSMUST00000001548 Trim30dE9PWL0 497 aa18.32■□□□□ 0.52
Itga3-201ENSMUST00000001548 Plcb2A3KGF7 1181 aa18.31■□□□□ 0.52
Itga3-201ENSMUST00000001548 Znf316Q6PGE4 1016 aa18.28■□□□□ 0.52
Itga3-201ENSMUST00000001548 Znf326O88291 580 aa18.26■□□□□ 0.51
Itga3-201ENSMUST00000001548 MsnP26041 577 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Itga3-201ENSMUST00000001548 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa18.24■□□□□ 0.51
Itga3-201ENSMUST00000001548 Eid3Q3V124 375 aa18.24■□□□□ 0.51
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