RNA–Protein interactions for RNA: YPR194C

OPT2, Transcript of Oligopeptide transporter, yeast

Gene OPT2, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OPT2	YPR194C	SUM1	P46676	1062 aa		4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	ROM1	P53046	1155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	MCM10	P32354	571 aa		4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
OPT2	YPR194C	UME1	Q03010	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	GAL1	P04385	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	NPR1	P22211	790 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	IME2	P32581	645 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	OXR1	Q08952	273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	LAP2	Q10740	671 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	INO80	P53115	1489 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	APN1	P22936	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	UGA3	P26370	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	IMP2'	P32351	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	NPL4	P33755	580 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	VPS35	P34110	944 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	KXD1	P53158	218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	SPO75	Q07798	868 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	TRE2	Q08693	809 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	CMP2	P14747	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	RGP1	P16664	663 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	SDH2	P21801	266 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	UBP1	P25037	809 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PGS1	P25578	521 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YHL008C	P38750	627 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	GEM1	P39722	662 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	SGM1	P47166	707 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	NSE5	Q03718	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	ESC2	Q06340	456 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	THI73	Q07904	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	ALR1	Q08269	859 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	SSP2	Q08646	371 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PGC1	Q08959	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	IDI1	P15496	288 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	VAN1	P23642	535 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	EUG1	P32474	517 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	ISF1	P32488	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PUS6	P53294	404 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	STF1	P01098	86 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	CAN1	P04817	590 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PLC1	P32383	869 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	ESL2	P36168	1195 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	VPS8	P39702	1274 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	CNN1	P43618	361 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	UGO1	Q03327	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	GAS4	Q08271	471 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	MOD5	P07884	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PET111	P08468	800 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	DBF20	P32328	564 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	NIP100	P33420	868 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	IML2	P47031	731 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	OPY2	Q06810	360 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	CCP1	P00431	361 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	TFC4	P33339	1025 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	RRF1	P38771	230 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YIL166C	P40445	542 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	SWA2	Q06677	668 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	TRS33	Q99394	268 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	RED1	P14291	827 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	CDC34	P14682	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YKL069W	P36088	180 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PIM1	P36775	1133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	ATG3	P40344	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	HUL4	P40985	892 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	APL6	P46682	809 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	SAE2	P46946	345 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
OPT2	YPR194C	RNH1	Q04740	348 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OPT2	YPR194C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	HSP78	P33416	811 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	NIC96	P34077	839 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	YKL133C	P36066	463 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	GPG1	P53130	126 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	HEH2	Q03281	663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	SGD1	Q06132	899 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	MLC2	Q06580	163 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OPT2	YPR194C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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