RNA–Protein interactions for RNA: YNR065C

YNR065C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNR065C, Length 3,351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR065C	YNR065C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	AIM21	P40563	679 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	YAF9	P53930	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	CST9	Q06032	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	RIF1	P29539	1916 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	KEX1	P09620	729 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	UGA4	P32837	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	VID27	P40157	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	DAK2	P43550	591 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	FUS2	Q05670	677 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	FOL1	P53848	824 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	ALG1	P16661	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	STV1	P37296	890 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	RXT2	P38255	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	SLI15	P38283	698 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	LEO1	P38439	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	CKA2	P19454	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TGL1	P34163	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	YKR018C	P36114	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	FOB1	O13329	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	CBP1	P07252	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	OCT1	P35999	772 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	LYS14	P40971	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	CUR1	Q06469	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	GPB2	P39717	880 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	VAB2	P40003	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TAF13	P11747	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	MOT1	P32333	1867 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YNR065C	YNR065C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YNR065C	YNR065C	PAN5	P38787	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TPM2	P40414	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	NPA3	P47122	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	YPR148C	Q06523	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TIP41	Q12199	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	MSP1	P28737	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	SEC8	P32855	1065 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	CIR1	P42940	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	YML020W	Q03722	664 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	SPH1	Q06160	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	YBL028C	P38202	106 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR065C	YNR065C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	TOP1	P04786	769 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	RIT1	P23796	513 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	MAL33	P38157	468 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	ACA1	P39970	489 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	MXR1	P40029	184 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	PCI8	P40512	444 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	YPT11	P48559	417 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	RTC4	P53850	401 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	ECM29	P38737	1868 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	PKC1	P24583	1151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	CHS3	P29465	1165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	SIS2	P36024	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	RSC30	P38781	883 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	VPS45	P38932	577 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	NUP82	P40368	713 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	CSM2	P40465	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	RBA50	Q04418	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	UBX5	Q06682	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	DCS2	Q12123	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR065C	YNR065C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.8 ms