RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 PIK3C2BO00750 1634 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 CERS3Q8IU89 383 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 PHF14O94880 888 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 CTR9Q6PD62 1173 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 SKAP1Q86WV1 359 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 PANK3Q9H999 370 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 PSEN1P49768 467 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 OGFRQ9NZT2 677 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 IQGAP1P46940 1657 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 CEP120Q8N960 986 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 SLIT1O75093 1534 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 NLRP13Q86W25 1043 aa9.52□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 HSCBQ8IWL3 235 aa9.52□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 SYNMO15061 1565 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 MCCP23508 829 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP2B3Q16720 1220 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 ADGRB3O60242 1522 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 SOCS7O14512 581 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 BANK1Q8NDB2 785 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 DEPDC5O75140 1603 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 USP19O94966 1318 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 TICAM2Q86XR7 235 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 TET3O43151 1660 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 PLIN1O60240 522 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 CDCA8Q53HL2 280 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 ZFYVE9O95405 1425 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 METP08581 1390 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 TULP2O00295 520 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 IGSF3O75054 1194 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 SOX12O15370 315 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 NGEFQ8N5V2 710 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 ADAMTS2O95450 1211 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.46□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.46□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.46□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.46□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.46□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
EFTUD2-218ENST00000590367 UNC13BO14795 1591 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-218ENST00000590367 BRINP3Q76B58 766 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-218ENST00000590367 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-218ENST00000590367 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-218ENST00000590367 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-218ENST00000590367 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-218ENST00000590367 E9PCH4 1651 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms