RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR6A1Q15406 480 aa7.38□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSS51Q4VC12 460 aa7.38□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.38□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 EEA1Q15075 1411 aa7.37□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 APBB1O00213 710 aa7.37□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR37L1O60883 481 aa7.37□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.37□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL21Q9HBE4 155 aa7.37□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.37□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.37□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.36□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.36□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADH1BP00325 375 aa7.36□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABL2P42684 1182 aa7.36□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.36□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.36□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF5Q13568 498 aa7.35□□□□□ -1.23
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RPS3AP54-201ENST00000435535 MMP16P51512 607 aa7.34□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPRNQ16849 979 aa7.34□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.34□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RPS3AP54-201ENST00000435535 HECW1Q76N89 1606 aa7.34□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.34□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP10Q9P2G4 905 aa7.33□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.33□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 POM121CA8CG34 1229 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 S1PR4O95977 384 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTHP32929 405 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNH2Q12809 1159 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF14Q15058 1648 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 WWC1Q8IX03 1113 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 RICTORQ6R327 1708 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNC4Q03721 635 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 VAC14Q08AM6 782 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP10BO94823 1461 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 WASHC4Q2M389 1173 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARID3AQ99856 593 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRL1O94910 1474 aa7.26□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.26□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.26□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNMA1Q8ND90 353 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLMNQ92990 594 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD109Q6YHK3 1445 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 PREX2Q70Z35 1606 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO45P0C2W1 286 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBBXA8MT70 800 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF223E7ERA6 249 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR1H3Q13133 447 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALG2Q9H553 416 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 MADDQ8WXG6 1647 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.21□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 FMN1Q68DA7 1419 aa7.21□□□□□ -1.25
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 FANCAO15360 1455 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBPF14Q5TI25 921 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAP1Q92560 729 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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