RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4a2P10630 407 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rad17Q6NXW6 688 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abca15E9PWH4 1668 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Robo1O89026 1612 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PtprvP70289 1705 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cadps2Q8BYR5 1297 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TatQ8QZR1 454 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hoxc9P09633 260 aa30.06■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zmym3Q9JLM4 1370 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Neurod2Q62414 383 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnajc10Q9DC23 793 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PalmQ9Z0P4 383 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem132eQ6IEE6 982 aa30.04■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf541Q0GGX2 1363 aa30.04■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tom1O88746 492 aa30.04■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fmnl2A2APV2 1086 aa30.02■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcl9lQ67FY2 1494 aa30.01■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Liat1Q810M6 228 aa30.01■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TnrQ8BYI9 1358 aa30.01■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ciz1Q8VEH2 845 aa29.99■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nid2O88322 1403 aa29.99■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myt1Q8CFC2 1127 aa29.99■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccne1Q61457 408 aa29.98■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21698A0A087WQP8 267 aa29.97■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21671G3UY31 267 aa29.97■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Apaf1O88879 1249 aa29.97■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fchsd2Q3USJ8 740 aa29.95■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MpripP97434 1024 aa29.94■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ptpn23Q6PB44 1692 aa29.94■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Parp14Q2EMV9 1817 aa29.94■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Acsbg1Q99PU5 721 aa29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Qtrt2B8ZXI1 415 aa29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc4a3P16283 1227 aa29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smim5Q8BT42 78 aa29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf526Q8BI66 675 aa29.92■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spef2Q8C9J3 1734 aa29.92■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eya1P97767 591 aa29.92■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp142G5E869 1843 aa29.91■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Card10P58660 1021 aa29.91■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rtl5Q5DTT4 599 aa29.9■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q4VA45 678 aa29.89■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Txnrd1Q9JMH6 613 aa29.89■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mcm10Q0VBD2 885 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ecm2Q5FW85 670 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Amotl2Q8K371 772 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ZgpatQ8VDM1 511 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa29.87■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa29.87■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa29.87■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29.87■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp777B9EKF4 885 aa29.86■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AampJ3QN89 436 aa29.85■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atxn3Q9CVD2 355 aa29.84■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HdgfP51859 237 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gas2l2Q5SSG4 860 aa29.83■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plin1Q8CGN5 517 aa29.83■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cavin4A2AMM0 362 aa29.82■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dusp27Q148W8 1138 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm6aO70546 1401 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim58Q5NCC9 485 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stk31Q99MW1 1018 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slit2Q9R1B9 1521 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 OptnQ8K3K8 584 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Apbb1Q9QXJ1 710 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf521Q6KAS7 1311 aa29.76■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CrklP47941 303 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cabp2Q9JLK4 216 aa29.75■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col15a1O35206 1367 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ksr2Q3UVC0 959 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pak3Q61036 559 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 RgmbQ7TQ33 436 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slx1bQ8BX32 270 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Iqcf3Q9D498 203 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TkfcQ8VC30 578 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Egfem1Q8C088 590 aa29.7■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa29.7■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Swt1Q9DBQ9 907 aa29.69■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slit1Q80TR4 1531 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pard3Q99NH2 1333 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HypkQ9CR41 129 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankrd50F7BE84 1390 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Simc1E9Q6E9 1354 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10471E9Q1C7 252 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 FocadA2AKG8 1798 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pank1Q8K4K6 548 aa29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.1 ms