Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH2

Pard3, Partitioning defective 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3Q99NH2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52.98■■■■■ 6.07
Pard3Q99NH2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
Pard3Q99NH2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
Pard3Q99NH2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
Pard3Q99NH2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.75■■■■■ 4.91
Pard3Q99NH2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Pard3Q99NH2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
Pard3Q99NH2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Pard3Q99NH2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Pard3Q99NH2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Pard3Q99NH2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
Pard3Q99NH2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
Pard3Q99NH2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Pard3Q99NH2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Pard3Q99NH2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Pard3Q99NH2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Pard3Q99NH2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Pard3Q99NH2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Pard3Q99NH2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Pard3Q99NH2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Pard3Q99NH2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Pard3Q99NH2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Pard3Q99NH2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Pard3Q99NH2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Pard3Q99NH2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Pard3Q99NH2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Pard3Q99NH2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Pard3Q99NH2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Pard3Q99NH2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Pard3Q99NH2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Pard3Q99NH2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Pard3Q99NH2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Pard3Q99NH2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Pard3Q99NH2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Pard3Q99NH2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Pard3Q99NH2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Pard3Q99NH2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Pard3Q99NH2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Pard3Q99NH2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Pard3Q99NH2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Pard3Q99NH2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Pard3Q99NH2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.01■■■■■ 4
Pard3Q99NH2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
Pard3Q99NH2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Pard3Q99NH2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pard3Q99NH2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Pard3Q99NH2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Pard3Q99NH2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Pard3Q99NH2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Pard3Q99NH2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Pard3Q99NH2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Pard3Q99NH2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Pard3Q99NH2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Pard3Q99NH2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Pard3Q99NH2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Pard3Q99NH2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Pard3Q99NH2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Pard3Q99NH2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Pard3Q99NH2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Pard3Q99NH2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Pard3Q99NH2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Pard3Q99NH2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Pard3Q99NH2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pard3Q99NH2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Pard3Q99NH2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Pard3Q99NH2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Pard3Q99NH2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Pard3Q99NH2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Pard3Q99NH2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Pard3Q99NH2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Pard3Q99NH2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Pard3Q99NH2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Pard3Q99NH2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Pard3Q99NH2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Pard3Q99NH2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Pard3Q99NH2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Pard3Q99NH2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Pard3Q99NH2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Pard3Q99NH2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Pard3Q99NH2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Pard3Q99NH2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pard3Q99NH2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Pard3Q99NH2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Pard3Q99NH2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Pard3Q99NH2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Pard3Q99NH2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Pard3Q99NH2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pard3Q99NH2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pard3Q99NH2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Pard3Q99NH2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Pard3Q99NH2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pard3Q99NH2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Pard3Q99NH2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Pard3Q99NH2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Pard3Q99NH2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Pard3Q99NH2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Pard3Q99NH2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Pard3Q99NH2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Pard3Q99NH2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Pard3Q99NH2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms