Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.95■■■■■ 5.91
Hoxc9P09633 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
Hoxc9P09633 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
Hoxc9P09633 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
Hoxc9P09633 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
Hoxc9P09633 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
Hoxc9P09633 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Hoxc9P09633 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
Hoxc9P09633 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Hoxc9P09633 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Hoxc9P09633 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
Hoxc9P09633 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Hoxc9P09633 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Hoxc9P09633 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.35
Hoxc9P09633 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Hoxc9P09633 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
Hoxc9P09633 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Hoxc9P09633 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Hoxc9P09633 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Hoxc9P09633 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Hoxc9P09633 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Hoxc9P09633 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Hoxc9P09633 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Hoxc9P09633 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Hoxc9P09633 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Hoxc9P09633 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Hoxc9P09633 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Hoxc9P09633 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Hoxc9P09633 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Hoxc9P09633 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
Hoxc9P09633 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Hoxc9P09633 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Hoxc9P09633 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
Hoxc9P09633 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Hoxc9P09633 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Hoxc9P09633 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Hoxc9P09633 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Hoxc9P09633 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Hoxc9P09633 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Hoxc9P09633 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Hoxc9P09633 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Hoxc9P09633 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Hoxc9P09633 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Hoxc9P09633 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Hoxc9P09633 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Hoxc9P09633 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Hoxc9P09633 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Hoxc9P09633 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Hoxc9P09633 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Hoxc9P09633 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Hoxc9P09633 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Hoxc9P09633 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Hoxc9P09633 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Hoxc9P09633 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Hoxc9P09633 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Hoxc9P09633 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Hoxc9P09633 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Hoxc9P09633 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Hoxc9P09633 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Hoxc9P09633 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Hoxc9P09633 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Hoxc9P09633 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Hoxc9P09633 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Hoxc9P09633 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Hoxc9P09633 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Hoxc9P09633 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Hoxc9P09633 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Hoxc9P09633 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Hoxc9P09633 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Hoxc9P09633 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Hoxc9P09633 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Hoxc9P09633 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Hoxc9P09633 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Hoxc9P09633 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Hoxc9P09633 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Hoxc9P09633 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Hoxc9P09633 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Hoxc9P09633 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Hoxc9P09633 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Hoxc9P09633 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Hoxc9P09633 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Hoxc9P09633 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Hoxc9P09633 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Hoxc9P09633 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Hoxc9P09633 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Hoxc9P09633 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Hoxc9P09633 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Hoxc9P09633 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Hoxc9P09633 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Hoxc9P09633 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Hoxc9P09633 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Hoxc9P09633 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Hoxc9P09633 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Hoxc9P09633 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Hoxc9P09633 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Hoxc9P09633 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Hoxc9P09633 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Hoxc9P09633 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Hoxc9P09633 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Hoxc9P09633 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms