RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48.68■■■■■ 5.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NischQ80TM9 1593 aa48.56■■■■■ 5.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abcc9P70170 1546 aa47.1■■■■■ 5.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abcc8B2RUS7 1588 aa46.66■■■■■ 5.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ScribQ80U72 1612 aa44.38■■■■■ 4.69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dcaf1Q80TR8 1506 aa43.22■■■■■ 4.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm5dQ62240 1548 aa43.16■■■■■ 4.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NacadQ5SWP3 1504 aa43.09■■■■■ 4.49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rhox8Q6VSS7 320 aa43.03■■■■■ 4.48
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42.4■■■■■ 4.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42.21■■■■■ 4.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc180J3QNE4 1664 aa41.91■■■■■ 4.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Baz1aO88379 1555 aa41.88■■■■■ 4.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rtl1Q7M732 1744 aa41.64■■■■■ 4.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crybg2B7ZCC2 1516 aa41.54■■■■■ 4.24
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BicraF8VPZ9 1578 aa41.48■■■■■ 4.23
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40.78■■■■■ 4.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40.28■■■■■ 4.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40.15■■■■■ 4.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa39.63■■■■□ 3.93
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Synj1Q8CHC4 1574 aa39.55■■■■□ 3.92
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CftrP26361 1476 aa39.52■■■■□ 3.92
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim41Q5NCC3 630 aa39.5■■■■□ 3.91
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa39.38■■■■□ 3.9
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ercc6F8VPZ5 1481 aa39.22■■■■□ 3.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39.13■■■■□ 3.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39.1■■■■□ 3.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa38.89■■■■□ 3.82
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa38.77■■■■□ 3.8
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HrcG5E8J6 738 aa38.71■■■■□ 3.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Golga3P55937 1487 aa38.69■■■■□ 3.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam135aQ6NS59 1506 aa38.64■■■■□ 3.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Unc13aQ4KUS2 1712 aa38.56■■■■□ 3.76
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cngb1E1AZ71 1325 aa38.54■■■■□ 3.76
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Top2bQ64511 1612 aa38.49■■■■□ 3.75
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubl4bQ9CQ84 188 aa38.25■■■■□ 3.71
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Baz1bQ9Z277 1479 aa38.12■■■■□ 3.69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38.09■■■■□ 3.69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kif15Q6P9L6 1387 aa38.06■■■■□ 3.68
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fmn1Q05860 1466 aa38.02■■■■□ 3.68
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TnnQ80Z71 1560 aa37.98■■■■□ 3.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa37.98■■■■□ 3.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Chic1Q8CBW7 227 aa37.87■■■■□ 3.65
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cux2P70298 1426 aa37.8■■■■□ 3.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mrc2Q64449 1479 aa37.76■■■■□ 3.63
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep164Q5DU05 1446 aa37.71■■■■□ 3.63
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Camsap1A2AHC3 1581 aa37.54■■■■□ 3.6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc18Q640L5 1455 aa37.51■■■■□ 3.6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Il27Q8K3I6 234 aa37.45■■■■□ 3.59
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kif21aQ9QXL2 1672 aa37.24■■■■□ 3.55
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa37.15■■■■□ 3.54
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Grin2bQ01097 1482 aa37.15■■■■□ 3.54
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gab3Q8BSM5 595 aa37.1■■■■□ 3.53
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NrkQ9R0G8 1455 aa36.99■■■■□ 3.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PtprkP35822 1457 aa36.92■■■■□ 3.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Duox2A2AQ99 1517 aa36.92■■■■□ 3.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crocc2F6XLV1 1638 aa36.87■■■■□ 3.49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shroom4Q1W617 1475 aa36.87■■■■□ 3.49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa36.86■■■■□ 3.49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36.84■■■■□ 3.49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Efcab5A0JP43 1406 aa36.84■■■■□ 3.49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plb1Q3TTY0 1478 aa36.76■■■■□ 3.47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Npm2Q80W85 207 aa36.7■■■■□ 3.47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Samd9lQ69Z37 1561 aa36.64■■■■□ 3.46
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep162Q6ZQ06 1403 aa36.58■■■■□ 3.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgap35Q91YM2 1499 aa36.47■■■■□ 3.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ift140E9PY46 1464 aa36.45■■■■□ 3.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36.44■■■■□ 3.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Disp1Q3TDN0 1521 aa36.41■■■■□ 3.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rad54l2Q99NG0 1466 aa36.41■■■■□ 3.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zeb1Q64318 1117 aa36.4■■■■□ 3.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SynmQ70IV5 1561 aa36.35■■■■□ 3.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Map3k1P53349 1493 aa36.34■■■■□ 3.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36.26■■■■□ 3.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myt1lP97500 1187 aa36.26■■■■□ 3.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Grin2aP35436 1464 aa36.2■■■■□ 3.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pla2r1Q62028 1487 aa36.17■■■■□ 3.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Setd1bQ8CFT2 1985 aa36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.4 ms