Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.17■■■■■ 6.1
Nid2O88322 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
Nid2O88322 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
Nid2O88322 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
Nid2O88322 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.06■■■■■ 4.96
Nid2O88322 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
Nid2O88322 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Nid2O88322 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Nid2O88322 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Nid2O88322 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.32■■■■■ 4.68
Nid2O88322 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Nid2O88322 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Nid2O88322 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
Nid2O88322 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Nid2O88322 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Nid2O88322 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
Nid2O88322 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Nid2O88322 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Nid2O88322 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Nid2O88322 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Nid2O88322 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Nid2O88322 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Nid2O88322 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Nid2O88322 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Nid2O88322 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Nid2O88322 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Nid2O88322 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Nid2O88322 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Nid2O88322 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Nid2O88322 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Nid2O88322 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Nid2O88322 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Nid2O88322 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Nid2O88322 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Nid2O88322 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Nid2O88322 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Nid2O88322 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Nid2O88322 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Nid2O88322 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Nid2O88322 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Nid2O88322 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Nid2O88322 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Nid2O88322 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Nid2O88322 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Nid2O88322 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Nid2O88322 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Nid2O88322 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Nid2O88322 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Nid2O88322 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Nid2O88322 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Nid2O88322 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Nid2O88322 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Nid2O88322 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Nid2O88322 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Nid2O88322 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
Nid2O88322 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Nid2O88322 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Nid2O88322 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Nid2O88322 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Nid2O88322 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Nid2O88322 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Nid2O88322 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Nid2O88322 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Nid2O88322 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Nid2O88322 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Nid2O88322 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Nid2O88322 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Nid2O88322 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Nid2O88322 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Nid2O88322 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Nid2O88322 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Nid2O88322 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Nid2O88322 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Nid2O88322 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Nid2O88322 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Nid2O88322 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Nid2O88322 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Nid2O88322 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Nid2O88322 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Nid2O88322 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Nid2O88322 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
Nid2O88322 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Nid2O88322 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Nid2O88322 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Nid2O88322 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Nid2O88322 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Nid2O88322 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Nid2O88322 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Nid2O88322 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Nid2O88322 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Nid2O88322 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Nid2O88322 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Nid2O88322 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Nid2O88322 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Nid2O88322 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Nid2O88322 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Nid2O88322 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Nid2O88322 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Nid2O88322 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Nid2O88322 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms