Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.73■■■■■ 5.87
Ccne1Q61457 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Ccne1Q61457 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Ccne1Q61457 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
Ccne1Q61457 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
Ccne1Q61457 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
Ccne1Q61457 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Ccne1Q61457 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Ccne1Q61457 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Ccne1Q61457 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Ccne1Q61457 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Ccne1Q61457 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Ccne1Q61457 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ccne1Q61457 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ccne1Q61457 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Ccne1Q61457 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Ccne1Q61457 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Ccne1Q61457 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ccne1Q61457 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccne1Q61457 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Ccne1Q61457 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccne1Q61457 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ccne1Q61457 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Ccne1Q61457 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Ccne1Q61457 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccne1Q61457 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ccne1Q61457 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Ccne1Q61457 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccne1Q61457 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Ccne1Q61457 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Ccne1Q61457 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Ccne1Q61457 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Ccne1Q61457 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Ccne1Q61457 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ccne1Q61457 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Ccne1Q61457 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ccne1Q61457 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
Ccne1Q61457 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccne1Q61457 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ccne1Q61457 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ccne1Q61457 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ccne1Q61457 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccne1Q61457 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ccne1Q61457 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccne1Q61457 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccne1Q61457 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Ccne1Q61457 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccne1Q61457 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ccne1Q61457 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccne1Q61457 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ccne1Q61457 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ccne1Q61457 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccne1Q61457 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccne1Q61457 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccne1Q61457 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccne1Q61457 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccne1Q61457 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccne1Q61457 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccne1Q61457 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccne1Q61457 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccne1Q61457 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccne1Q61457 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccne1Q61457 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccne1Q61457 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccne1Q61457 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ccne1Q61457 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccne1Q61457 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccne1Q61457 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ccne1Q61457 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccne1Q61457 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ccne1Q61457 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccne1Q61457 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccne1Q61457 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccne1Q61457 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccne1Q61457 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccne1Q61457 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccne1Q61457 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ccne1Q61457 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ccne1Q61457 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ccne1Q61457 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccne1Q61457 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccne1Q61457 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccne1Q61457 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccne1Q61457 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccne1Q61457 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccne1Q61457 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccne1Q61457 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccne1Q61457 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccne1Q61457 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccne1Q61457 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccne1Q61457 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccne1Q61457 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccne1Q61457 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccne1Q61457 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccne1Q61457 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccne1Q61457 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccne1Q61457 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ccne1Q61457 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccne1Q61457 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccne1Q61457 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms