RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	MGE1	P38523	228 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	LSO1	Q3E827	93 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	YJR115W	P47152	169 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	FRT1	Q99332	602 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	PDR11	P40550	1411 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	DOP1	Q03921	1698 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	ATE1	P16639	503 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	ISC10	P32645	267 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	ESL2	P36168	1195 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	VMR1	P38735	1592 aa		7.15	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	SVF1	Q05515	481 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	BDS1	Q08347	646 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	TAF5	P38129	798 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	YBR197C	P38306	217 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	TRS120	Q04183	1289 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	DFG5	Q05031	458 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	WTM2	Q12206	467 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	NUP192	P47054	1683 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	STE6	P12866	1290 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	UFD2	P54860	961 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	CAB1	Q04430	367 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	IML1	P47170	1584 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	IOC4	Q04213	475 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	TRM3	Q07527	1436 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	MET4	P32389	672 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	SEC8	P32855	1065 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	YBL086C	P38177	466 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
PSH1	YOL054W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	MCM1	P11746	286 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	RPB10	P22139	70 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	SCD5	P34758	872 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	YJR107W	P47145	328 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	CDC45	Q08032	650 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	APC11	Q12157	165 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	STB3	Q12427	513 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	MET1	P36150	593 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	SUM1	P46676	1062 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	MRPL33	P20084	86 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	SPE2	P21182	396 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	HXT5	P38695	592 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	ACO2	P39533	789 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	YPQ2	Q06328	317 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	SMC1	P32908	1225 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	CAF120	P53836	1060 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PSH1	YOL054W	SAM37	P50110	327 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	GPI13	Q07830	1017 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	HXT8	P40886	569 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	CDC55	Q00362	526 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	OPT2	Q06593	877 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	UGA3	P26370	528 aa		7	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	LDH1	P38139	375 aa		7	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	FYV10	P40492	516 aa		7	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	YNL011C	P53980	444 aa		7	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	MNL2	Q12205	849 aa		7	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	DNF3	Q12674	1656 aa		7	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	BCK1	Q01389	1478 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	RPC31	P17890	251 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	VMA3	P25515	160 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	VPS35	P34110	944 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	DYS1	P38791	387 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	FIR1	P40020	876 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	YTA6	P40328	754 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	NNF1	P47149	201 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	MTC5	Q03897	1148 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	OXR1	Q08952	273 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	SNF2	P22082	1703 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	YAP3	P38749	330 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	DAK2	P43550	591 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	IME2	P32581	645 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	PEP7	P32609	515 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSH1	YOL054W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29

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