RNA–Protein interactions for RNA: YGL017W

ATE1, Transcript of Arginyl-tRNA-protein transferase, yeast

Gene ATE1, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATE1	YGL017W	TLG1	Q03322	224 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	APC1	P53886	1748 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	SIR4	P11978	1358 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	ASF1	P32447	279 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	YGR130C	P53278	816 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	CTR9	P89105	1077 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	MET32	Q12041	191 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ATE1	YGL017W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	PRD1	P25375	712 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	TTI1	P36097	1038 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	RSC30	P38781	883 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	ITC1	P53125	1264 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	RGA1	P39083	1007 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	not detected
ATE1	YGL017W	XKS1	P42826	600 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	THI22	Q06490	572 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	AUS1	Q08409	1394 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	ASH1	P34233	588 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	RPA14	P50106	137 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	MEC3	Q02574	474 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	COG8	Q04632	607 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	GAS4	Q08271	471 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	YPP1	P46951	817 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	YML020W	Q03722	664 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	YPR097W	Q06839	1073 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	AFT1	P22149	690 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	UBP1	P25037	809 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	DOT5	P40553	215 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	YNL011C	P53980	444 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	TBF1	Q02457	562 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	GRX3	Q03835	250 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	YDL206W	Q12424	762 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	SRS2	P12954	1174 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	YKL133C	P36066	463 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	SLX8	P40072	274 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	CTF4	Q01454	927 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	HIM1	Q06674	414 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	ALR1	Q08269	859 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	SPC110	P32380	944 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	LCD1	Q04377	747 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATE1	YGL017W	HST3	P53687	447 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	BRN1	P38170	754 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	RTT109	Q07794	436 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	MET22	P32179	357 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	OSW7	P43611	510 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	YJL181W	P46987	611 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	RIM21	P48565	533 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	TPO2	P53283	614 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	ESC2	Q06340	456 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	DSD1	P53095	428 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	RSC1	P53236	928 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	YML083C	Q04526	418 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	MRX10	Q05648	414 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	RAD50	P12753	1312 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	NUP145	P49687	1317 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.18	□□□□□ -1.42	not detected
ATE1	YGL017W	NNF2	P53253	936 aa		6.18	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	COB	P00163	385 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	PUP1	P25043	261 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	ISF1	P32488	338 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	DLD1	P32891	587 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	BDH2	P39713	417 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	TPM2	P40414	161 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	YKR075C	P36155	307 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	RKM3	P38222	552 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	RRT14	P40470	206 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	KTR7	P40504	517 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	ATG36	P46983	293 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	YPL062W	Q02781	134 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	NKP2	Q06162	153 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	ATG13	Q06628	738 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ATE1	YGL017W	MCM16	Q12262	181 aa		6.16	□□□□□ -1.42

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