RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0297Q0297 PEX29Q03370 554 aa20.62■□□□□ 0.89
Q0297Q0297 MSH4P40965 878 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
Q0297Q0297 KAR5Q04746 504 aa20.6■□□□□ 0.89
Q0297Q0297 STM1P39015 273 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Q0297Q0297 CST9Q06032 482 aa20.59■□□□□ 0.89
Q0297Q0297 YPL260WQ08977 551 aa20.59■□□□□ 0.89
Q0297Q0297 SPT21P35209 758 aa20.58■□□□□ 0.89
Q0297Q0297 YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 TAH18Q12181 623 aa20.57■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 BBC1P47068 1157 aa20.56■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 PPM2Q08282 695 aa20.56■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 KIN1P13185 1064 aa20.55■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 RBA50Q04418 439 aa20.55■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 TUB2P02557 457 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 APE3P37302 537 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 RSC30P38781 883 aa20.54■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 RRP8P38961 392 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 ACA1P39970 489 aa20.54■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 SNU71P53207 620 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 RAD50P12753 1312 aa20.53■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 VAS1P07806 1104 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 OPI1P21957 404 aa20.52■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 JIP4Q03361 876 aa20.52■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 SRF1Q12516 437 aa20.52■□□□□ 0.88
Q0297Q0297 LAM4P38800 1345 aa20.52■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 MRD1Q06106 887 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 RIM20Q12033 661 aa20.51■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 COQ1P18900 473 aa20.5■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 MPH3P0CE00 602 aa20.49■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 CST26P38226 397 aa20.49■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 RTS1P38903 757 aa20.49■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 PRE8P23639 250 aa20.47■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 MOT2P34909 587 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 OCT1P35999 772 aa20.47■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 MET1P36150 593 aa20.47■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 LAP2Q10740 671 aa20.46■□□□□ 0.87
Q0297Q0297 YHL050CP38721 697 aa20.45■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 VID27P40157 782 aa20.45■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 ASH1P34233 588 aa20.44■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 SRM1P21827 482 aa20.43■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 RAD61Q99359 647 aa20.43■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 CHO2P05374 869 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 LYS14P40971 790 aa20.41■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 AAP1P37898 856 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 RPS15Q01855 142 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Q0297Q0297 SPR3P41901 512 aa20.39■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 NCS6P53088 359 aa20.39■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 UFD2P54860 961 aa20.39■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 FBP1P09201 348 aa20.38■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 YDJ1P25491 409 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 MCD4P36051 919 aa20.38■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 NET1P47035 1189 aa20.38■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 KRS1P15180 591 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 VAB2P40003 282 aa20.37■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 SUB2Q07478 446 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 ERG12P07277 443 aa20.36■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 BRN1P38170 754 aa20.36■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 VPS8P39702 1274 aa20.36■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 SGD1Q06132 899 aa20.36■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 TIF4631P39935 952 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 SKG3Q06315 1026 aa20.35■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 IXR1P33417 597 aa20.34■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data20.33■□□□□ 0.85not detected
Q0297Q0297 CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
Q0297Q0297 CHS3P29465 1165 aa20.32■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 ERG7P38604 731 aa20.32■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 YJL007CP47080 104 aa20.32■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 TPM1P17536 199 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 ACE2P21192 770 aa20.31■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 RIT1P23796 513 aa20.3■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 PRO3P32263 286 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 GCR2Q01722 534 aa20.3■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 ANP1P32629 500 aa20.29■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 SPB4P25808 606 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 IMP2'P32351 346 aa20.27■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 MYO3P36006 1272 aa20.27■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data20.27■□□□□ 0.84not detected
Q0297Q0297 YML037CQ03703 340 aa20.27■□□□□ 0.84
Q0297Q0297 SAM2P19358 384 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 PER1P25625 357 aa20.26■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 CDC60P26637 1090 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 CIC1P38779 376 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 HXT17P53631 564 aa20.26■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 RER2P35196 286 aa20.25■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 PGA3Q12746 312 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 DLD1P32891 587 aa20.24■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 SRS2P12954 1174 aa20.23■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 HXT13P39924 564 aa20.23■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 ATG1P53104 897 aa20.23■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 SOL4P53315 255 aa20.23■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 UBX5Q06682 500 aa20.23■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 TUS1Q06412 1307 aa20.23■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 UBP9P39967 754 aa20.22■□□□□ 0.83
Q0297Q0297 HDA1P53973 706 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.8 ms