RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000219578.1

Gm30906-201, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Gm30906, Length 535 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa18.68■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 NgefQ8CHT1 710 aa18.68■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Tet3Q8BG87 1668 aa18.67■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Gimap6Q8K349 305 aa18.67■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 TimelessQ9R1X4 1197 aa18.67■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Fyb1O35601 819 aa18.66■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Cadps2Q8BYR5 1297 aa18.66■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ncoa4Q5U4H9 625 aa18.65■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Slc35g1Q8BY79 368 aa18.65■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Scn7aB1AYL1 1681 aa18.65■□□□□ 0.58
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Hoxb7P09024 217 aa18.63■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa18.63■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ubr1O70481 1757 aa18.6■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Siglec1Q62230 1695 aa18.6■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Dcaf11Q91VU6 549 aa18.6■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ano8Q6PB70 1060 aa18.59■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Dixdc1Q80Y83 711 aa18.59■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Kif7B7ZNG0 1348 aa18.58■□□□□ 0.57
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Qtrt2B8ZXI1 415 aa18.58■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Znf526Q8BI66 675 aa18.58■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Nfat5Q9WV30 1534 aa18.58■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Robo1O89026 1612 aa18.57■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Rad17Q6NXW6 688 aa18.56■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa18.56■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Dennd6aQ8BH65 605 aa18.55■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Nlgn1Q99K10 843 aa18.55■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Nid2O88322 1403 aa18.55■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 PaskQ8CEE6 1383 aa18.55■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 ZgpatQ8VDM1 511 aa18.54■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Kcnh5Q920E3 988 aa18.54■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa18.54■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Slit2Q9R1B9 1521 aa18.54■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa18.53■□□□□ 0.56
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa18.51■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Dzip1Q8BMD2 852 aa18.51■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa18.51■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Sall2Q9QX96 1004 aa18.5■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 TnrQ8BYI9 1358 aa18.5■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Tex14Q7M6U3 1450 aa18.5■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 FancaQ9JL70 1439 aa18.49■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa18.49■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 HdgfP51859 237 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Map2P20357 1828 aa18.48■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 PtprvP70289 1705 aa18.48■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Cntnap1O54991 1385 aa18.46■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa18.45■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa18.45■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Fmnl2A2APV2 1086 aa18.44■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Card10P58660 1021 aa18.44■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Trim28Q62318 834 aa18.44■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Slx1bQ8BX32 270 aa18.43■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Cabp4Q8VHC5 271 aa18.43■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ptpn23Q6PB44 1692 aa18.43■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa18.42■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Nyap1Q6PFX7 833 aa18.42■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Birc3O08863 600 aa18.41■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa18.41■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 TatQ8QZR1 454 aa18.4■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Lrp6O88572 1613 aa18.4■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Pard3Q99NH2 1333 aa18.4■□□□□ 0.54
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Gm21698A0A087WQP8 267 aa18.39■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Gm21671G3UY31 267 aa18.39■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Dnajc10Q9DC23 793 aa18.39■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Atf7ipQ7TT18 1306 aa18.39■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Shank2Q80Z38 1476 aa18.39■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Sema6bO54951 886 aa18.38■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ppp1r15aP17564 657 aa18.38■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Emilin2Q8K482 1074 aa18.38■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Smim5Q8BT42 78 aa18.37■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Acsbg1Q99PU5 721 aa18.37■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Zfp777B9EKF4 885 aa18.36■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Hoxc9P09633 260 aa18.36■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ecm2Q5FW85 670 aa18.36■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Amotl2Q8K371 772 aa18.36■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Slit1Q80TR4 1531 aa18.34■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa18.34■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Rtl5Q5DTT4 599 aa18.34■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Txnrd1Q9JMH6 613 aa18.34■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 FocadA2AKG8 1798 aa18.33■□□□□ 0.53
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Cypt2Q6P924 180 aa18.32■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Exoc6Q8R313 802 aa18.32■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 P2rx7Q9Z1M0 595 aa18.32■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Kdm6aO70546 1401 aa18.32■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ggt6Q6PDE7 497 aa18.31■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 MypopQ8R4U1 393 aa18.31■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Rsph6aQ8CDR2 708 aa18.3■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa18.3■□□□□ 0.52
Gm30906-201ENSMUST00000219578 Spef2Q8C9J3 1734 aa18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 81.2 ms