RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049241.8

Hoxb4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxb4, Length 2,566 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 NinlQ6ZQ12 1394 aa22.14■■□□□ 1.14
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Arhgef28P97433 1693 aa22.14■■□□□ 1.14
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gsto1O09131 240 aa22.14■■□□□ 1.14
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Q9D9H8 365 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 PrkcshO08795 521 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Abca14E9Q8F8 1683 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cdk19Q8BWD8 501 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pnmal2G3X9N3 661 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kif13aQ9EQW7 1749 aa22.09■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 CastP51125 788 aa22.09■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.09■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 ArxO35085 564 aa22.08■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cluap1Q8R3P7 413 aa22.08■■□□□ 1.13
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cavin4A2AMM0 362 aa22.08■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ankrd50F7BE84 1390 aa22.08■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 NktrP30415 1453 aa22.07■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa22.07■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ecm2Q5FW85 670 aa22.06■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa22.05■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Slc12a5Q91V14 1138 aa22.05■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ccdc60Q8C4J0 545 aa22.04■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Atl3Q91YH5 541 aa22.04■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa22.04■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ciz1Q8VEH2 845 aa22.03■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Znf330Q922H9 316 aa22.03■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Afap1Q80YS6 731 aa22.03■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Naip7Q9JIB3 1402 aa22.03■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 AU019823E9PUQ3 292 aa22.02■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 PalmQ9Z0P4 383 aa22.02■■□□□ 1.12
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Usp32F8VPZ3 1604 aa22.02■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Znf541Q0GGX2 1363 aa22.02■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 PaskQ8CEE6 1383 aa22.02■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gm6268A2A3U9 297 aa22.01■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Q4VA45 678 aa22■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Synj2Q9D2G5 1434 aa22■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 FanciQ8K368 1330 aa21.99■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Sptbn5F6UCX4 1208 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 PplQ9R269 1755 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Plekhg1F6S200 1446 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Trim28Q62318 834 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pdlim2Q8R1G6 349 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Irx3P81067 507 aa21.97■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pik3r4Q8VD65 1358 aa21.97■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Map3k19E9Q3S4 1311 aa21.97■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Swt1Q9DBQ9 907 aa21.96■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Nutm1Q8BHP2 1126 aa21.96■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa21.96■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Nwd1A6H603 1563 aa21.95■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Asxl2Q8BZ32 1370 aa21.95■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Fchsd2Q3USJ8 740 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Atp7bQ64446 1462 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Birc3O08863 600 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rabep1O35551 862 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Nectin2P32507 530 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Hs1bp3Q3TC93 395 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Znf316Q6PGE4 1016 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tmco5bQ80X59 307 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Nsd3Q6P2L6 1439 aa21.89■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa21.89■■□□□ 1.1
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kif18aQ91WD7 886 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ppp1r15aP17564 657 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Htatsf1Q8BGC0 757 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Map7O88735 730 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Q3UPC7 1272 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 SkilQ60665 675 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Vamp4O70480 141 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kif2cQ922S8 721 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rsph4aQ8BYM7 716 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cog6Q8R3I3 657 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mcm10Q0VBD2 885 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Aplp1Q03157 653 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Dip2aQ8BWT5 1523 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kif1aP33173 1695 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 RictorQ6QI06 1708 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Spef2Q8C9J3 1734 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 NpatQ8BMA5 1420 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 MvpQ9EQK5 861 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.9 ms