RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	YKU70	P32807	602 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	DJP1	P40564	432 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	GCR2	Q01722	534 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	NPL4	P33755	580 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	YIR014W	P40570	242 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	IRC4	Q03036	179 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	SHC1	P39000	512 aa		6.78	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	6.78	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	RIM20	Q12033	661 aa		6.78	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	CYB2	P00175	591 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	DLD1	P32891	587 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	GEF1	P37020	779 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	BRN1	P38170	754 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	SET4	P42948	560 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	RMD1	Q03441	430 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	DPL1	Q05567	589 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	6.77	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	OPI1	P21957	404 aa		6.76	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	6.76	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	6.76	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	PBY1	P38254	753 aa		6.76	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	YFH7	P43591	353 aa		6.76	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	PIB2	P53191	635 aa		6.76	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	INM2	Q05533	292 aa		6.76	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	BBC1	P47068	1157 aa		6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	CLC1	P17891	233 aa		6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	JJJ2	P46997	583 aa		6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	KAR5	Q04746	504 aa		6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	RLF2	Q12495	606 aa		6.75	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	FLO1	P32768	1537 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	ARG82	P07250	355 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	YIR042C	P40586	236 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	TOS4	Q06266	489 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	ATG20	Q07528	640 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	TAH18	Q12181	623 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	PCT1	P13259	424 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	HXT13	P39924	564 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	IOC3	P43596	787 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	FPK1	P53739	893 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	LAM4	P38800	1345 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	TOP1	P04786	769 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	SNF3	P10870	884 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	GRX7	P38068	203 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	HXT17	P53631	564 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	GAS5	Q08193	484 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	IRC8	P47046	822 aa		6.72	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	6.72	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	GSC2	P40989	1895 aa		6.72	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	CRF1	Q04930	467 aa		6.71	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	FLO11	P08640	1367 aa		6.71	□□□□□ -1.33
AMD1	YML035C	MSM1	P22438	575 aa		6.71	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	APL6	P46682	809 aa		6.71	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	MET1	P36150	593 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	GSM1	P42950	618 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	AFG2	P32794	780 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	MDL2	P33311	773 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.7	□□□□□ -1.34	not detected
AMD1	YML035C	SPO22	P40511	975 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	PIP2	P52960	996 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	PUS6	P53294	404 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	PPM2	Q08282	695 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	YJL171C	P46992	396 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	YGL081W	P53156	320 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	GLC3	P32775	704 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	TIM50	Q02776	476 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	YLR278C	Q05854	1341 aa		6.67	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	COQ1	P18900	473 aa		6.67	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	SLI15	P38283	698 aa		6.67	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	AAD16	Q02895	342 aa		6.67	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	6.67	□□□□□ -1.34	RIP-Chip
AMD1	YML035C	RTS1	P38903	757 aa		6.67	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	ROX1	P25042	368 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	PEP3	P27801	918 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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