RNA–Protein interactions for RNA: YHR006W

STP2, Transcript of Transcription factor, yeast

Gene STP2, Length 1,626 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STP2	YHR006W	QDR2	P40474	542 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STP2	YHR006W	YFL066C	P43538	392 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STP2	YHR006W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
STP2	YHR006W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
STP2	YHR006W	YBR197C	P38306	217 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STP2	YHR006W	SKP1	P52286	194 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STP2	YHR006W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
STP2	YHR006W	MRPL33	P20084	86 aa		4.71	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	HEH2	Q03281	663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	SRS2	P12954	1174 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	VMA3	P25515	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	RPC31	P17890	251 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	ISC10	P32645	267 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	GEF1	P37020	779 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	YNR014W	P53719	212 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	APM2	P38700	605 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	DYS1	P38791	387 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	LDH1	P38139	375 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	YNR040W	P53736	256 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	MET1	P36150	593 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	BOI2	P39969	1040 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	PRK1	P40494	810 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	PNP1	Q05788	311 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	TDA6	Q06466	467 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
STP2	YHR006W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STP2	YHR006W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	RRN6	P32786	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	GIP1	P38229	639 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	ITC1	P53125	1264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	HSL1	P34244	1518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	BSD2	P38356	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	ALG14	P38242	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	KOG1	P38873	1557 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	IDI1	P15496	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	ISW1	P38144	1129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	MSN1	P22148	382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	NHA1	Q99271	985 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	SKN7	P38889	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	FIR1	P40020	876 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	HXT8	P40886	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	MRP10	O75012	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	YBR287W	P38355	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	BOL3	P39724	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	GIS4	Q04233	774 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	DNA2	P38859	1522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	RSC2	Q06488	889 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	APC11	Q12157	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP2	YHR006W	RPB10	P22139	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	YIL165C	P40446	119 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
STP2	YHR006W	KTR2	P33550	425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	TAT1	P38085	619 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	AIM46	P38885	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	RGD2	P43556	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	YJL181W	P46987	611 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	PRY1	P47032	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	PPT1	P53043	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	KAR5	Q04746	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	SSN2	P38931	1420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	SMC1	P32908	1225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	RAD55	P38953	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	HIR3	P47171	1648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	NTA1	P40354	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	BUD9	P53226	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	SLP1	Q12232	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	RRM3	P38766	723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	MCA1	Q08601	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STP2	YHR006W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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