RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W DYS1P38791 387 aa6.84□□□□□ -1.31
PRD1YCL057W ALD2P47771 506 aa6.84□□□□□ -1.31
PRD1YCL057W PSH1Q12161 406 aa6.84□□□□□ -1.31
PRD1YCL057W PDC6P26263 563 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W RPC31P17890 251 aa6.83□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W KAP122P32767 1081 aa6.83□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W SMC1P32908 1225 aa6.83□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W PAM1P37304 830 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W LEU1P07264 779 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W YTA6P40328 754 aa6.82□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W PHO4P07270 312 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W MSN1P22148 382 aa6.82□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W RSC4Q02206 625 aa6.82□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W TCB1Q12466 1186 aa6.82□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W YNL011CP53980 444 aa6.81□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W CDC55Q00362 526 aa6.81□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W STB3Q12427 513 aa6.81□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W INO80P53115 1489 aa6.81□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W NTA1P40354 457 aa6.8□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W RGD2P43556 714 aa6.8□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W YJR107WP47145 328 aa6.8□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W RGA1P39083 1007 aa6.8□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W BRE2P43132 505 aa6.79□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W UBP15P50101 1230 aa6.79□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W MTO1P53070 669 aa6.79□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W SKP1P52286 194 aa6.79□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W UBP2Q01476 1272 aa6.79□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W CDC19P00549 500 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data6.78□□□□□ -1.32not detected
PRD1YCL057W RAD55P38953 406 aa6.78□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W OPT2Q06593 877 aa6.78□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W YOR296WQ08748 1289 aa6.78□□□□□ -1.32
PRD1YCL057W ISW1P38144 1129 aa6.77□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W GIP1P38229 639 aa6.77□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W MGE1P38523 228 aa6.77□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W NOP7P53261 605 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W FIR1P40020 876 aa6.77□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W DAK2P43550 591 aa6.77□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W SEC8P32855 1065 aa6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W BSD2P38356 321 aa6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W GCR2Q01722 534 aa6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W RGP1P16664 663 aa6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W IRS4P36115 615 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W YLR346CQ06139 101 aa6.76□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W GCD6P32501 712 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W VPS35P34110 944 aa6.75□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W OSH7P38755 437 aa6.75□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W PSY2P40164 858 aa6.75□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W SAM37P50110 327 aa6.74□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W BSC2Q05611 235 aa6.74□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W TY1A-BLQ12266 440 aa6.74□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W RPT1P33299 467 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W YBR287WP38355 427 aa6.73□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W ITC1P53125 1264 aa6.72□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W SVF1Q05515 481 aa6.72□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W APM2P38700 605 aa6.71□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PRD1YCL057W MET1P36150 593 aa6.71□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W FYV10P40492 516 aa6.71□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W SCW11P53189 542 aa6.71□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W MRPL16P38064 232 aa6.7□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W CIC1P38779 376 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W CTR9P89105 1077 aa6.7□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W AIM46P38885 310 aa6.7□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W MET10P39692 1035 aa6.7□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W YIL165CP40446 119 aa6.7□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W YNR040WP53736 256 aa6.7□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W FLP1P03870 423 aa6.68□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W TOS4Q06266 489 aa6.68□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W MET22P32179 357 aa6.68□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W COBP00163 385 aa6.67□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W INP54Q08227 384 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W MCM2P29469 868 aa6.67□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W YER156CP40093 338 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W YGR122WP53272 402 aa6.67□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W NCL1P38205 684 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W SPR28Q04921 423 aa6.66□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W OXR1Q08952 273 aa6.66□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W HXK1P04806 485 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W YDR444WQ04093 687 aa6.65□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W TY1A-MR1Q04215 440 aa6.65□□□□□ -1.34
PRD1YCL057W DIT1P21623 536 aa6.65□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W YHL008CP38750 627 aa6.65□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W RMD1Q03441 430 aa6.65□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W MSH6Q03834 1242 aa6.65□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W YCS4Q06156 1176 aa6.65□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W MSC7P38694 644 aa6.64□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W ROG3P43602 733 aa6.64□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W CCP1P00431 361 aa6.64□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W CYC8P14922 966 aa6.64□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W DUR3P33413 735 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms