RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.39
USP34-208	ENST00000467128	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	PKD2	Q13563	968 aa		12.58	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		12.58	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		12.57	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		12.57	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	MED14	O60244	1454 aa		12.57	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	TRPM2	O94759	1503 aa		12.57	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		12.56	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		12.55	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		12.54	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	PSEN1	P49768	467 aa		12.54	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	IQGAP1	P46940	1657 aa		12.54	□□□□□ -0.4
USP34-208	ENST00000467128	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		12.51	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	HRC	P23327	699 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	IDI1	Q13907	227 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		12.49	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	CLTCL1	P53675	1640 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	ZFYVE9	O95405	1425 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	SPOCK2	Q92563	424 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	KIF1B	O60333	1816 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41	1e-11	■■■■□ 22.7
USP34-208	ENST00000467128	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.46	□□□□□ -0.41
USP34-208	ENST00000467128	DIP2A	Q14689	1571 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	GOLGA2	Q08379	1002 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	TRIM52	Q96A61	297 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	CPS1	P31327	1500 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	MARVELD3	Q96A59	401 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	EID1	Q9Y6B2	187 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	LTK	P29376	864 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	NWD1	Q149M9	1564 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	12.41	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	CABP2	Q9NPB3	220 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
USP34-208	ENST00000467128	PPL	O60437	1756 aa		12.39	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	IFT172	Q9UG01	1749 aa		12.39	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	PIK3R4	Q99570	1358 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	SNPH	O15079	494 aa		12.36	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	CERK	Q8TCT0	537 aa		12.36	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		12.35	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		12.34	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
USP34-208	ENST00000467128	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.33	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	POTEB	Q6S5H4	581 aa		12.33	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	FBXO41	Q8TF61	875 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	TBX22	Q9Y458	520 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	MYOM2	P54296	1465 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	LAMC1	P11047	1609 aa		12.31	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		12.3	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	KCNA6	P17658	529 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	PIK3C2G	O75747	1445 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.27	□□□□□ -0.44
USP34-208	ENST00000467128	EMP3	P54852	163 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP34-208	ENST00000467128	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP34-208	ENST00000467128	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP34-208	ENST00000467128	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
USP34-208	ENST00000467128	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45

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