RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc52a2Q9D8F3 450 aa27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dcaf11Q91VU6 549 aa27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NeflP08551 543 aa27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KdrP35918 1367 aa27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CrbnQ8C7D2 445 aa27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Qser1A2BIE1 1698 aa27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 InsrP15208 1372 aa27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stag3O70576 1240 aa27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp19Q3UJD6 1360 aa27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc4a3P16283 1227 aa27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plekhh1Q80TI1 1356 aa27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Afap1Q80YS6 731 aa27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nlrp6Q91WS2 869 aa27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtprmP28828 1452 aa27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NpatQ8BMA5 1420 aa27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pak3Q61036 559 aa27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rsph4aQ8BYM7 716 aa27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IqubQ8CDK3 788 aa27.7■■■□□ 2.03
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif13aQ9EQW7 1749 aa27.69■■■□□ 2.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa27.67■■■□□ 2.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnga1P29974 684 aa27.67■■■□□ 2.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Egfem1Q8C088 590 aa27.67■■■□□ 2.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa27.66■■■□□ 2.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenpjQ569L8 1344 aa27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa27.62■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RictorQ6QI06 1708 aa27.62■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp1b4Q99ME6 356 aa27.62■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Shq1Q7TMX5 569 aa27.61■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Golga2Q921M4 999 aa27.61■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rwdd1Q9CQK7 243 aa27.61■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk26Q99JT2 416 aa27.6■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc30Q8BVF4 654 aa27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Naip7Q9JIB3 1402 aa27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrxn1Q9CS84 1514 aa27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgef28P97433 1693 aa27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrl1Q80TR1 1466 aa27.57■■■□□ 2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uspl1Q3ULM6 1089 aa27.56■■■□□ 2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa27.55■■■□□ 2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Iqsec2Q5DU25 1478 aa27.55■■■□□ 2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ralbp1Q62172 648 aa27.54■■■□□ 2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep170bQ80U49 1574 aa27.53■■■□□ 2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zmym3Q9JLM4 1370 aa27.51■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa27.51■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9D9H8 365 aa27.5■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Neurod2Q62414 383 aa27.48■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GsdmaQ9EST1 446 aa27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P2rx7Q9Z1M0 595 aa27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ipo9Q91YE6 1041 aa27.45■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abca14E9Q8F8 1683 aa27.42■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajc5gQ8C632 165 aa27.41■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zranb1Q7M760 708 aa27.4■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plekhg1F6S200 1446 aa27.4■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PplQ9R269 1755 aa27.39■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttll13A4Q9F6 804 aa27.39■■□□□ 1.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa27.36■■□□□ 1.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa27.36■■□□□ 1.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apbb1Q9QXJ1 710 aa27.35■■□□□ 1.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gsto1O09131 240 aa27.34■■□□□ 1.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NktrP30415 1453 aa27.33■■□□□ 1.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dip2aQ8BWT5 1523 aa27.33■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk19Q8BWD8 501 aa27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gas2l2Q5SSG4 860 aa27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asxl2Q8BZ32 1370 aa27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nwd1A6H603 1563 aa27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tsen2Q6P7W5 460 aa27.28■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EspnQ9ET47 871 aa27.28■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atxn3Q9CVD2 355 aa27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf521Q6KAS7 1311 aa27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psme1P97371 249 aa27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Txndc2Q6P902 515 aa27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam135bQ9DAI6 1403 aa27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp32F8VPZ3 1604 aa27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B4galnt3Q6L8S8 986 aa27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf541Q0GGX2 1363 aa27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NinlQ6ZQ12 1394 aa27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim58Q5NCC9 485 aa27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FanciQ8K368 1330 aa27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chmp5Q9D7S9 219 aa27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apaf1O88879 1249 aa27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AampJ3QN89 436 aa27.2■■□□□ 1.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plppr3Q7TPB0 716 aa27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.4 ms