RNA–Protein interactions for RNA: YJL109C

UTP10, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP10, Length 5,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP10	YJL109C	GDB1	Q06625	1536 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	UBR1	P19812	1950 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	IQG1	Q12280	1495 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	RPO31	P04051	1460 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	SIN3	P22579	1536 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YBR016W	P38216	128 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	HSL1	P34244	1518 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	TOM7	P53507	60 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	POL1	P13382	1468 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	MYO4	P32492	1471 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	RIF1	P29539	1916 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	NUP159	P40477	1460 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	RPS27B	P38711	82 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	HOR7	Q05827	59 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	SCC2	Q04002	1493 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	KOG1	P38873	1557 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	STT4	P37297	1900 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	GSC2	P40989	1895 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	VPS15	P22219	1454 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UTP10	YJL109C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.21	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	NCE101	Q02820	53 aa		0.21	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	UBR2	Q07963	1872 aa		0.2	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	CDC25	P04821	1589 aa		0.2	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	MYO1	P08964	1928 aa		0.2	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	MOT1	P32333	1867 aa		0.2	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	RPL39	P04650	51 aa		0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	BPT1	P14772	1559 aa		0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	YIL177C	P40434	1758 aa		0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	YJL225C	P40889	1758 aa		0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	IML1	P47170	1584 aa		0.19	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	DNF2	Q12675	1612 aa		0.18	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	PDR10	P51533	1564 aa		0.18	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	VTH1	P40438	1549 aa		0.18	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	VTH2	P40890	1549 aa		0.18	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	NUM1	Q00402	2748 aa		0.18	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	IRC20	Q06554	1556 aa		0.18	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	DNF1	P32660	1571 aa		0.17	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	STU1	P38198	1513 aa		0.17	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.17	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.17	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	BCK1	Q01389	1478 aa		0.16	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	TY2B-C	P25384	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.38
UTP10	YJL109C	ECM29	P38737	1868 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	HKR1	P41809	1802 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		0.15	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	NUP170	P38181	1502 aa		0.14	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	FLO1	P32768	1537 aa		0.14	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.14	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	PDR12	Q02785	1511 aa		0.14	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	RIM15	P43565	1770 aa		0.13	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	NTE1	Q04958	1679 aa		0.13	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	SSK2	P53599	1579 aa		0.13	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	HIR3	P47171	1648 aa		0.13	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	DNF3	Q12674	1656 aa		0.12	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		0.12	□□□□□ -2.39
UTP10	YJL109C	DOP1	Q03921	1698 aa		0.12	□□□□□ -2.39

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