RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C UBC5P15732 148 aa-0.63□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C PDX3P38075 228 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa-0.63□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C NTE1Q04958 1679 aa-0.63□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C COX7P10174 60 aa-0.64□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C MIX14Q04341 121 aa-0.65□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa-0.65□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa-0.65□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C BPT1P14772 1559 aa-0.66□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C HMRA1P0CY11 126 aa-0.68□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C BPH1P25356 2167 aa-0.69□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C YBR090CP38253 122 aa-0.7□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C YHL005CP38752 130 aa-0.7□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C RRT15Q3E811 62 aa-0.7□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C KSH1Q8TGJ3 72 aa-0.71□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C EMC5P40540 141 aa-0.72□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C RPS12P48589 143 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
YKL111CYKL111C YER137CP40083 148 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C TOM6P33448 61 aa-0.74□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C YDR246W-AQ3E763 66 aa-0.74□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C SDH6Q3E785 79 aa-0.75□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C TY1B-BRQ12193 1756 aa-0.75□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C YMR122W-AQ3E842 84 aa-0.76□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C TSC11P40061 1430 aa-0.76□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C HKR1P41809 1802 aa-0.76□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C DNF3Q12674 1656 aa-0.77□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C YHR214C-DP0CX93 97 aa-0.77□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C RPS29AP41057 56 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C SNU13P39990 126 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C BSC4P53841 131 aa-0.78□□□□□ -2.53
YKL111CYKL111C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C YGR025WP53216 100 aa-0.79□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C PDR11P40550 1411 aa-0.8□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C YAL065CO13511 128 aa-0.8□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C ATP18P81450 59 aa-0.8□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C PMD1P32634 1753 aa-0.82□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C ECM12O13529 151 aa-0.82□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C YBL044WP38194 122 aa-0.84□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C SIN3P22579 1536 aa-0.84□□□□□ -2.54
YKL111CYKL111C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa-0.85□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C FPR2P32472 135 aa-0.85□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C PAU23Q07987 124 aa-0.86□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C PAU17Q12370 124 aa-0.86□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa-0.87□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C MHF2Q3E829 80 aa-0.87□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C STT4P37297 1900 aa-0.87□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C REV3P14284 1504 aa-0.88□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C YDR029WQ12111 104 aa-0.89□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C POL1P13382 1468 aa-0.89□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C YCR085WP25650 117 aa-0.9□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C FYV7Q12247 151 aa-0.9□□□□□ -2.55
YKL111CYKL111C YDR042CQ03205 200 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C SUS1Q6WNK7 96 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-MR1Q04214 1755 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-NL1Q12112 1755 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-GR1Q12141 1755 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-GR3Q12316 1755 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C TY1B-ORQ92393 1755 aa-0.91□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C YBR032WP38223 100 aa-0.93□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C ECM29P38737 1868 aa-0.94□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C PDR10P51533 1564 aa-0.94□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C THO2P53552 1597 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C SCP1Q08873 200 aa-0.96□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-0.97□□□□□ -2.56
YKL111CYKL111C MMS1Q06211 1407 aa-0.98□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C YMR001C-AQ8TGS9 76 aa-0.99□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C GDB1Q06625 1536 aa-0.99□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa-1.01□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa-1.01□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-ER2Q03619 1755 aa-1.01□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-DR1Q03855 1755 aa-1.01□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-GR2Q12269 1755 aa-1.01□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-JR1P47098 1755 aa-1.02□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C MDS3P53094 1487 aa-1.02□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-ER1Q03612 1755 aa-1.02□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-OLQ12273 1755 aa-1.02□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa-1.02□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C TY1B-DR3Q99231 1755 aa-1.02□□□□□ -2.57
YKL111CYKL111C MOT1P32333 1867 aa-1.05□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.5 ms