Protein–RNA interactions for Protein: P38752

YHL005C, Uncharacterized protein YHL005C, yeastyeast

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL005CP38752 NSR1YGR159C 1245 nt12.34□□□□□ -0.43
YHL005CP38752 YML009W-BYML009W-B 477 nt12.18□□□□□ -0.46
YHL005CP38752 NOP1YDL014W 984 nt11.89□□□□□ -0.51
YHL005CP38752 MDJ1YFL016C 1536 nt10.99□□□□□ -0.65
YHL005CP38752 YKL036CYKL036C 393 nt10.76□□□□□ -0.69
YHL005CP38752 SSA3YBL075C 1950 nt10.58□□□□□ -0.72
YHL005CP38752 SRX1YKL086W 384 nt10.34□□□□□ -0.75
YHL005CP38752 Q0297Q0297 156 nt10.31□□□□□ -0.76
YHL005CP38752 YJL027CYJL027C 417 nt10.23□□□□□ -0.77
YHL005CP38752 YCR051WYCR051W 669 nt9.75□□□□□ -0.85
YHL005CP38752 DBP2YNL112W 1641 nt9.64□□□□□ -0.87
YHL005CP38752 SCS3YGL126W 1143 nt9.63□□□□□ -0.87
YHL005CP38752 YBR190WYBR190W 312 nt9.53□□□□□ -0.88
YHL005CP38752 TRN1tP(UGG)A 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 SUF9tP(UGG)F 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 SUF8tP(UGG)H 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 SUF7tP(UGG)M 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 SUF11tP(UGG)O2 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YHL005CP38752 YOL085CYOL085C 342 nt9.28□□□□□ -0.92
YHL005CP38752 RTC3YHR087W 336 nt9.27□□□□□ -0.93
YHL005CP38752 CCC1YLR220W 969 nt9.27□□□□□ -0.93
YHL005CP38752 RPP1BYDL130W 321 nt9.23□□□□□ -0.93
YHL005CP38752 RVS167YDR388W 1449 nt9.18□□□□□ -0.94
YHL005CP38752 PUT4YOR348C 1884 nt9.12□□□□□ -0.95
YHL005CP38752 PKP1YIL042C 1185 nt9.09□□□□□ -0.95
YHL005CP38752 SSA4YER103W 1929 nt9.06□□□□□ -0.96
YHL005CP38752 SPT5YML010W 3192 nt8.99□□□□□ -0.97
YHL005CP38752 PAC11YDR488C 1602 nt8.98□□□□□ -0.97
YHL005CP38752 SCJ1YMR214W 1134 nt8.94□□□□□ -0.98
YHL005CP38752 NVJ2YPR091C 2313 nt8.86□□□□□ -0.99
YHL005CP38752 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt8.84□□□□□ -0.99
YHL005CP38752 BDF1YLR399C 2061 nt8.82□□□□□ -1
YHL005CP38752 FPS1YLL043W 2010 nt8.78□□□□□ -1
YHL005CP38752 PET122YER153C 765 nt8.78□□□□□ -1
YHL005CP38752 SHR5YOL110W 714 nt8.78□□□□□ -1
YHL005CP38752 SCR1SCR1 522 nt8.75□□□□□ -1.01
YHL005CP38752 POA1YBR022W 534 nt8.74□□□□□ -1.01
YHL005CP38752 BSC6YOL137W 1494 nt8.71□□□□□ -1.01
YHL005CP38752 SSA1YAL005C 1929 nt8.71□□□□□ -1.02
YHL005CP38752 ARE1YCR048W 1833 nt8.69□□□□□ -1.02
YHL005CP38752 TAT1YBR069C 1860 nt8.69□□□□□ -1.02
YHL005CP38752 YDJ1YNL064C 1230 nt8.63□□□□□ -1.03
YHL005CP38752 URN1YPR152C 1398 nt8.6□□□□□ -1.03
YHL005CP38752 ATS1YAL020C 1002 nt8.58□□□□□ -1.04
YHL005CP38752 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt8.56□□□□□ -1.04
YHL005CP38752 RPN10YHR200W 807 nt8.54□□□□□ -1.04
YHL005CP38752 OPI9YLR338W 858 nt8.54□□□□□ -1.04
YHL005CP38752 RRN5YLR141W 1092 nt8.52□□□□□ -1.05
YHL005CP38752 YJL225CYJL225C 5277 nt8.5□□□□□ -1.05
YHL005CP38752 DEP1YAL013W 1218 nt8.47□□□□□ -1.05
YHL005CP38752 SAH1YER043C 1350 nt8.47□□□□□ -1.05
YHL005CP38752 YNL208WYNL208W 600 nt8.44□□□□□ -1.06
YHL005CP38752 GAR1YHR089C 618 nt8.37□□□□□ -1.07
YHL005CP38752 YER088W-BYER088W-B 147 nt8.35□□□□□ -1.07
YHL005CP38752 PUN1YLR414C 792 nt8.34□□□□□ -1.07
YHL005CP38752 RSB1YOR049C 1065 nt8.31□□□□□ -1.08
YHL005CP38752 MEP2YNL142W 1500 nt8.29□□□□□ -1.08
YHL005CP38752 BUD23YCR047C 828 nt8.28□□□□□ -1.08
YHL005CP38752 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.24□□□□□ -1.09
YHL005CP38752 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.24□□□□□ -1.09
YHL005CP38752 YJR018WYJR018W 363 nt8.22□□□□□ -1.09
YHL005CP38752 PTC2YER089C 1395 nt8.18□□□□□ -1.1
YHL005CP38752 UME6YDR207C 2511 nt8.14□□□□□ -1.11
YHL005CP38752 YBR220CYBR220C 1683 nt8.14□□□□□ -1.11
YHL005CP38752 NAB2YGL122C 1578 nt8.14□□□□□ -1.11
YHL005CP38752 TIR1YER011W 765 nt8.13□□□□□ -1.11
YHL005CP38752 PCH2YBR186W 1695 nt8.09□□□□□ -1.11
YHL005CP38752 DCW1YKL046C 1350 nt8.09□□□□□ -1.12
YHL005CP38752 GUT2YIL155C 1950 nt8.08□□□□□ -1.12
YHL005CP38752 RPP2BYDR382W 333 nt8.07□□□□□ -1.12
YHL005CP38752 YMR090WYMR090W 684 nt8.07□□□□□ -1.12
YHL005CP38752 SEC11YIR022W 504 nt8.03□□□□□ -1.12
YHL005CP38752 INM2YDR287W 879 nt8.01□□□□□ -1.13
YHL005CP38752 DAL1YIR027C 1383 nt7.99□□□□□ -1.13
YHL005CP38752 EMI2YDR516C 1503 nt7.99□□□□□ -1.13
YHL005CP38752 PST2YDR032C 597 nt7.97□□□□□ -1.13
YHL005CP38752 YJR120WYJR120W 351 nt7.96□□□□□ -1.14
YHL005CP38752 FIS1YIL065C 468 nt7.95□□□□□ -1.14
YHL005CP38752 SDH1YKL148C 1923 nt7.94□□□□□ -1.14
YHL005CP38752 FPR4YLR449W 1179 nt7.93□□□□□ -1.14
YHL005CP38752 BOR1YNL275W 1731 nt7.92□□□□□ -1.14
YHL005CP38752 PIB2YGL023C 1908 nt7.91□□□□□ -1.14
YHL005CP38752 PHO4YFR034C 939 nt7.89□□□□□ -1.15
YHL005CP38752 YPS1YLR120C 1710 nt7.89□□□□□ -1.15
YHL005CP38752 YDL221WYDL221W 552 nt7.87□□□□□ -1.15
YHL005CP38752 RPM1RPM1 483 nt7.86□□□□□ -1.15
YHL005CP38752 YBL100CYBL100C 315 nt7.84□□□□□ -1.15
YHL005CP38752 BDH2YAL061W 1254 nt7.83□□□□□ -1.16
YHL005CP38752 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt7.82□□□□□ -1.16
YHL005CP38752 RTF1YGL244W 1677 nt7.79□□□□□ -1.16
YHL005CP38752 MCH5YOR306C 1566 nt7.76□□□□□ -1.17
YHL005CP38752 SCC4YER147C 1875 nt7.76□□□□□ -1.17
YHL005CP38752 YDR095CYDR095C 411 nt7.75□□□□□ -1.17
YHL005CP38752 SRB2YHR041C 633 nt7.74□□□□□ -1.17
YHL005CP38752 LSM3YLR438C-A 270 nt7.74□□□□□ -1.17
YHL005CP38752 FUN26YAL022C 1554 nt7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.6 ms