RNA–Protein interactions for RNA: YJR003C

YJR003C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YJR003C, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR003C	YJR003C	SHH3	Q04487	196 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	DYN3	Q04949	312 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	UPS1	Q05776	175 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	IRC23	Q08416	157 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	VAM10	Q08474	114 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	HPA3	P39979	161 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	SER2	P42941	309 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	UBC12	P52491	188 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	DAD4	P69851	72 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	YPL067C	Q02754	198 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	LCL1	Q02786	101 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	YDR476C	Q03362	224 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	YMR252C	Q04814	134 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJR003C	YJR003C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	HTB2	P02294	131 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	RPB7	P34087	171 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YER134C	P40081	178 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	MMS2	P53152	137 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	HHT1	P61830	136 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	RNH202	Q05635	350 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	RFU1	Q08003	200 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YOL014W	Q08110	124 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	COX8	P04039	78 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	MRS1	P07266	363 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	CBF1	P17106	351 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YEL008W	P40001	126 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	TDA4	P47153	279 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	TTI2	P47168	421 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YGL235W	P53071	178 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YPR127W	Q06494	345 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YLR031W	Q07978	186 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	FIT2	Q08906	153 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	TIR1	P10863	254 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	SFK1	P35735	353 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	MTW1	P39731	289 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	UPS3	Q04006	179 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	DAS2	Q12084	232 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	MHF2	Q3E829	80 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	NTG1	P31378	399 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	ARO7	P32178	256 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	PAM17	P36147	197 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	RFC2	P40348	353 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	TOM7	P53507	60 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YNL033W	P53964	284 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	AIM36	Q03798	255 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YMR253C	Q04835	414 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	QCR7	P00128	127 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	CPR5	P35176	225 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	CAF4	P36130	643 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	SPC25	P40014	221 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YNL184C	P53876	108 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	DML1	Q03652	475 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	NAT3	Q06504	195 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YOL131W	Q08270	108 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	IGO2	Q9P305	131 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	SNF4	P12904	322 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YCR023C	P25351	611 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	ETR1	P38071	380 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	SPC1	P46965	94 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YKR005C	Q02203	525 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YET3	Q07451	203 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJR003C	YJR003C	RIB3	Q99258	208 aa		0.42	□□□□□ -2.34

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