RNA–Protein interactions for RNA: YLR317W

YLR317W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLR317W, Length 435 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR317W	YLR317W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YBL071C	P38185	102 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YDL183C	P48569	320 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YNR071C	P53757	342 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	STD1	Q02794	444 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MRX11	Q03079	207 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	NDE2	Q07500	545 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	SOR2	Q07786	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	RNH203	Q12338	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	PAM17	P36147	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	CSH1	P38287	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YER134C	P40081	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	TDA4	P47153	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YHP1	Q04116	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	SDH7	Q04401	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	FIT2	Q08906	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YLR302C	O13544	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MRS1	P07266	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	ZRT1	P32804	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YPT10	P38146	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MOH1	P38191	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	PAU7	P39545	55 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	BDH1	P39714	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	PIR5	P46999	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	CYC3	P06182	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	UTR5	P32630	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	RAV2	Q03956	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	CSM4	Q08955	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	RKI1	Q12189	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	HTB2	P02294	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MDM10	P18409	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	SFT2	P38166	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	DOG2	P38773	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	HAC1	P41546	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YJL028W	P47062	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YGL230C	P53074	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	CRZ1	P53968	678 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YDR366C	P87287	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	CDC43	P18898	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YCR022C	P25620	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YBR090C	P38253	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YBR220C	P38318	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	LST8	P41318	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YFR045W	P43617	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YGR018C	P53211	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YGR151C	P53287	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	HST4	P53688	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YNL046W	P53956	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	UPS3	Q04006	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	GAT3	Q07928	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	RPL39	P04650	51 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	MIC26	P50087	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	SDS23	P53172	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	TOM7	P53507	60 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YML079W	Q03629	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	CSI2	Q08054	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR317W	YLR317W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	SEC11	P15367	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	MRP49	P32388	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	RRT1	P38192	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YHL037C	P38733	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YLR317W	YLR317W	YIP1	P53039	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	BRP1	P53194	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 183.7 ms