Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 NSR1YGR159C 1245 nt16.34■□□□□ 0.21
YHP1Q04116 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.16■□□□□ 0.18
YHP1Q04116 NOP1YDL014W 984 nt15.6■□□□□ 0.09
YHP1Q04116 MDJ1YFL016C 1536 nt14.82□□□□□ -0.04
YHP1Q04116 YKL036CYKL036C 393 nt14.41□□□□□ -0.1
YHP1Q04116 Q0297Q0297 156 nt13.64□□□□□ -0.23
YHP1Q04116 SRX1YKL086W 384 nt13.64□□□□□ -0.23
YHP1Q04116 YJL027CYJL027C 417 nt13.61□□□□□ -0.23
YHP1Q04116 SCS3YGL126W 1143 nt13.11□□□□□ -0.31
YHP1Q04116 DBP2YNL112W 1641 nt13.02□□□□□ -0.32
YHP1Q04116 YCR051WYCR051W 669 nt12.93□□□□□ -0.34
YHP1Q04116 YBR190WYBR190W 312 nt12.7□□□□□ -0.38
YHP1Q04116 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHP1Q04116 YOL085CYOL085C 342 nt12.45□□□□□ -0.42
YHP1Q04116 RTC3YHR087W 336 nt12.34□□□□□ -0.43
YHP1Q04116 CCC1YLR220W 969 nt12.32□□□□□ -0.44
YHP1Q04116 PKP1YIL042C 1185 nt12.27□□□□□ -0.45
YHP1Q04116 RPP1BYDL130W 321 nt12.24□□□□□ -0.45
YHP1Q04116 RVS167YDR388W 1449 nt12.08□□□□□ -0.48
YHP1Q04116 SCJ1YMR214W 1134 nt12.06□□□□□ -0.48
YHP1Q04116 PUT4YOR348C 1884 nt11.8□□□□□ -0.52
YHP1Q04116 SSA3YBL075C 1950 nt11.76□□□□□ -0.53
YHP1Q04116 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.73□□□□□ -0.53
YHP1Q04116 ATS1YAL020C 1002 nt11.73□□□□□ -0.53
YHP1Q04116 PET122YER153C 765 nt11.68□□□□□ -0.54
YHP1Q04116 SHR5YOL110W 714 nt11.64□□□□□ -0.55
YHP1Q04116 SCR1SCR1 522 nt11.61□□□□□ -0.55
YHP1Q04116 ARE1YCR048W 1833 nt11.49□□□□□ -0.57
YHP1Q04116 URN1YPR152C 1398 nt11.48□□□□□ -0.57
YHP1Q04116 OPI9YLR338W 858 nt11.41□□□□□ -0.58
YHP1Q04116 SAH1YER043C 1350 nt11.4□□□□□ -0.59
YHP1Q04116 YDJ1YNL064C 1230 nt11.38□□□□□ -0.59
YHP1Q04116 DEP1YAL013W 1218 nt11.37□□□□□ -0.59
YHP1Q04116 RRN5YLR141W 1092 nt11.35□□□□□ -0.59
YHP1Q04116 POA1YBR022W 534 nt11.35□□□□□ -0.59
YHP1Q04116 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.33□□□□□ -0.6
YHP1Q04116 RPN10YHR200W 807 nt11.23□□□□□ -0.61
YHP1Q04116 BSC6YOL137W 1494 nt11.2□□□□□ -0.62
YHP1Q04116 YNL208WYNL208W 600 nt11.18□□□□□ -0.62
YHP1Q04116 RSB1YOR049C 1065 nt11.15□□□□□ -0.62
YHP1Q04116 GAR1YHR089C 618 nt11.13□□□□□ -0.63
YHP1Q04116 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.12□□□□□ -0.63
YHP1Q04116 PUN1YLR414C 792 nt11.06□□□□□ -0.64
YHP1Q04116 SPT5YML010W 3192 nt11□□□□□ -0.65
YHP1Q04116 BUD23YCR047C 828 nt10.99□□□□□ -0.65
YHP1Q04116 PTC2YER089C 1395 nt10.96□□□□□ -0.65
YHP1Q04116 YJR018WYJR018W 363 nt10.93□□□□□ -0.66
YHP1Q04116 NAB2YGL122C 1578 nt10.86□□□□□ -0.67
YHP1Q04116 PST2YDR032C 597 nt10.85□□□□□ -0.67
YHP1Q04116 YJR120WYJR120W 351 nt10.8□□□□□ -0.68
YHP1Q04116 TIR1YER011W 765 nt10.78□□□□□ -0.68
YHP1Q04116 FIS1YIL065C 468 nt10.76□□□□□ -0.69
YHP1Q04116 SSA1YAL005C 1929 nt10.74□□□□□ -0.69
YHP1Q04116 DAL1YIR027C 1383 nt10.68□□□□□ -0.7
YHP1Q04116 SSA4YER103W 1929 nt10.67□□□□□ -0.7
YHP1Q04116 RPP2BYDR382W 333 nt10.59□□□□□ -0.71
YHP1Q04116 PHO4YFR034C 939 nt10.59□□□□□ -0.71
YHP1Q04116 INM2YDR287W 879 nt10.57□□□□□ -0.72
YHP1Q04116 FPR4YLR449W 1179 nt10.57□□□□□ -0.72
YHP1Q04116 SRB2YHR041C 633 nt10.56□□□□□ -0.72
YHP1Q04116 MEP2YNL142W 1500 nt10.55□□□□□ -0.72
YHP1Q04116 YPS1YLR120C 1710 nt10.5□□□□□ -0.73
YHP1Q04116 YKL097CYKL097C 411 nt10.48□□□□□ -0.73
YHP1Q04116 YBL100CYBL100C 315 nt10.43□□□□□ -0.74
YHP1Q04116 YDR095CYDR095C 411 nt10.4□□□□□ -0.74
YHP1Q04116 SHU1YHL006C 453 nt10.4□□□□□ -0.74
YHP1Q04116 DCW1YKL046C 1350 nt10.39□□□□□ -0.75
YHP1Q04116 BDH2YAL061W 1254 nt10.38□□□□□ -0.75
YHP1Q04116 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.34□□□□□ -0.75
YHP1Q04116 BDF1YLR399C 2061 nt10.32□□□□□ -0.76
YHP1Q04116 FUN26YAL022C 1554 nt10.31□□□□□ -0.76
YHP1Q04116 WWM1YFL010C 636 nt10.26□□□□□ -0.77
YHP1Q04116 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.23□□□□□ -0.77
YHP1Q04116 EMI2YDR516C 1503 nt10.23□□□□□ -0.77
YHP1Q04116 PTP1YDL230W 1008 nt10.21□□□□□ -0.77
YHP1Q04116 TAT1YBR069C 1860 nt10.19□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 LSM3YLR438C-A 270 nt10.19□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 TRM9YML014W 840 nt10.18□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 ALF1YNL148C 765 nt10.18□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 RPP2AYOL039W 321 nt10.17□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 CCT6YDR188W 1641 nt10.17□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 CAC2YML102W 1407 nt10.16□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 YBR220CYBR220C 1683 nt10.15□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 YDL221WYDL221W 552 nt10.15□□□□□ -0.78
YHP1Q04116 YGR021WYGR021W 873 nt10.14□□□□□ -0.79
YHP1Q04116 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.12□□□□□ -0.79
YHP1Q04116 YMR090WYMR090W 684 nt10.12□□□□□ -0.79
YHP1Q04116 HOM6YJR139C 1080 nt10.09□□□□□ -0.79
YHP1Q04116 SIS1YNL007C 1059 nt10.09□□□□□ -0.79
YHP1Q04116 SDH1YKL148C 1923 nt10.07□□□□□ -0.8
YHP1Q04116 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.06□□□□□ -0.8
YHP1Q04116 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.06□□□□□ -0.8
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