RNA–Protein interactions for RNA: YML034W

SRC1, Transcript of Inner nuclear membrane protein, yeast

Gene SRC1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRC1	YML034W	SWI5	P08153	709 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	BRE2	P43132	505 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	SRF1	Q12516	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	GCR2	Q01722	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	BUD4	P47136	1447 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	GEF1	P37020	779 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	NUP85	P46673	744 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	SGS1	P35187	1447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	DLD1	P32891	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	CYT1	P07143	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	SUM1	P46676	1062 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	VAN1	P23642	535 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	UBP1	P25037	809 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	REV3	P14284	1504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	MDS3	P53094	1487 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	SSN3	P39073	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	YJR098C	P47139	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	LSC2	P53312	427 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	TRS33	Q99394	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	SUV3	P32580	737 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	MSN5	P52918	1224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	PUN1	Q06991	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRC1	YML034W	MCM1	P11746	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	OPT2	Q06593	877 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	DAL1	P32375	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	VTC4	P47075	721 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	SRS2	P12954	1174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	MET22	P32179	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	CWH41	P53008	833 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	PNP1	Q05788	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	SLA1	P32790	1244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	HIR3	P47171	1648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	JJJ2	P46997	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	YNL165W	P53891	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	HXT5	P38695	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	PEP1	P32319	1579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	YBR197C	P38306	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	CAB1	Q04430	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	IRE1	P32361	1115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	SCW11	P53189	542 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	SCD5	P34758	872 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	OSH7	P38755	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	HAT1	Q12341	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	BPT1	P14772	1559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRC1	YML034W	MLF3	P32047	452 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	BOL3	P39724	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	KAR5	Q04746	504 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	ISC10	P32645	267 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	RRN6	P32786	894 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	UBP15	P50101	1230 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	MRPL33	P20084	86 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	PSH1	Q12161	406 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	RGA1	P39083	1007 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	YTA6	P40328	754 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	VMA3	P25515	160 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	ACO2	P39533	789 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	ERP5	P38819	212 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	ALD2	P47771	506 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	ATG1	P53104	897 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	YML020W	Q03722	664 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRC1	YML034W	ROG3	P43602	733 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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