RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	ERP5	P38819	212 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	BOL3	P39724	118 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	WTM2	Q12206	467 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	SRS2	P12954	1174 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	TBS1	P38114	1094 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	BDS1	Q08347	646 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	SLD2	P34252	453 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPC17	YJL011C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	ATG1	P53104	897 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	YPQ2	Q06328	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	RGA2	Q06407	1009 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	CAB1	Q04430	367 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	AFT1	P22149	690 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	CWH41	P53008	833 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	MCM1	P11746	286 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	IPL1	P38991	367 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	RTT106	P40161	455 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	MDJ2	P42834	146 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	SUM1	P46676	1062 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	UGA3	P26370	528 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	ASH1	P34233	588 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	YBR197C	P38306	217 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	YHL050C	P38721	697 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	YHR219W	P38900	624 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	QDR1	P40475	563 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	ISC10	P32645	267 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	HXT5	P38695	592 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	AAD14	P42884	376 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	HST3	P53687	447 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	YPL062W	Q02781	134 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	LSO1	Q3E827	93 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	RRN6	P32786	894 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RPC17	YJL011C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	RPB10	P22139	70 aa		6.88	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	MET22	P32179	357 aa		6.88	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	FRT1	Q99332	602 aa		6.88	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	ARG82	P07250	355 aa		6.87	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.87	□□□□□ -1.31	not detected
RPC17	YJL011C	SEC20	P28791	383 aa		6.87	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	ACF4	P47129	309 aa		6.87	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	NUT2	Q06213	157 aa		6.87	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	WHI5	Q12416	295 aa		6.87	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	HEM3	P28789	327 aa		6.86	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	KTR2	P33550	425 aa		6.86	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	PPX1	P38698	397 aa		6.86	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	YNL165W	P53891	406 aa		6.86	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	APC11	Q12157	165 aa		6.86	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	SCD5	P34758	872 aa		6.85	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	SSN3	P39073	555 aa		6.85	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	YJR115W	P47152	169 aa		6.85	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	MRPL33	P20084	86 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	DLD1	P32891	587 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	JJJ2	P46997	583 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPC17	YJL011C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		6.83	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	MLF3	P32047	452 aa		6.82	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	SPR3	P41901	512 aa		6.82	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	MSN5	P52918	1224 aa		6.82	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	YDR444W	Q04093	687 aa		6.82	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	6.82	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		6.82	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	YJR098C	P47139	656 aa		6.81	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	TRS120	Q04183	1289 aa		6.81	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	SRF1	Q12516	437 aa		6.81	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	6.8	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	VMA3	P25515	160 aa		6.8	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.8	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	SLA1	P32790	1244 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	THI12	P42883	340 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	THI5	P43534	340 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	THI11	P47183	340 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	THI13	Q07748	340 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	MET4	P32389	672 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	NUP85	P46673	744 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	VTC4	P47075	721 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	GPI13	Q07830	1017 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPC17	YJL011C	ATE1	P16639	503 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RPC17	YJL011C	IRE1	P32361	1115 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RPC17	YJL011C	ASF1	P32447	279 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RPC17	YJL011C	QDR2	P40474	542 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RPC17	YJL011C	POL32	P47110	350 aa		6.77	□□□□□ -1.33

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