RNA–Protein interactions for RNA: YER167W

BCK2, Transcript of Serine/threonine-rich protein involved in PKC1 signaling pathway, yeast

Gene BCK2, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK2	YER167W	PEX5	P35056	612 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	APE4	P38821	490 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	SPO20	Q04359	397 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	PET111	P08468	800 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RAD4	P14736	754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	HOL1	P53389	586 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	UBP1	P25037	809 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YGR016W	P53209	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RSC1	P53236	928 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RIA1	P53893	1110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	INH1	P01097	85 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YHL050C	P38721	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YHR219W	P38900	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
BCK2	YER167W	AAD3	P25612	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	MTC2	P34246	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	PAF1	P38351	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	MXR1	P40029	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	MAM1	P40065	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	ACF4	P47129	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	TCB2	P48231	1178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RTP1	Q12751	981 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	PIF1	P07271	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	MRC1	P25588	1096 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	TEA1	P47988	759 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	KEL2	P50090	882 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	SLX4	Q12098	748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	PEX6	P33760	1030 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	CSN12	P47130	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	SPC110	P32380	944 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YKL222C	P35995	705 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	BDF2	Q07442	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	ISW2	Q08773	1120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	MNL2	Q12205	849 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	JNM1	P36224	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YJR107W	P47145	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	SPS1	P08458	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	CAJ1	P39101	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	NDE1	P40215	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	PEX21	P50091	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	NNF2	P53253	936 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	MSB4	Q12317	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	GTT3	P39996	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	EMP47	P43555	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YJL049W	P47048	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	MDJ2	P42834	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YGR130C	P53278	816 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	PCL8	Q08966	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	APN1	P22936	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	NIP100	P33420	868 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	DAS1	P47005	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RAD17	P48581	401 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	VPS16	Q03308	798 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCK2	YER167W	RRN3	P36070	627 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SAP190	P36123	1033 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	VPS41	P38959	992 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	THI12	P42883	340 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	THI5	P43534	340 aa		4.59	□□□□□ -1.68

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