RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
CS-217ENST00000550044 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.06■□□□□ 0
CS-217ENST00000550044 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.06■□□□□ 0
CS-217ENST00000550044 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.05■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.05■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.05■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 IQGAP1P46940 1657 aa15.05■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 DEPDC5O75140 1603 aa15.04■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.04■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
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CS-217ENST00000550044 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 SYNMO15061 1565 aa15.03■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 PZPP20742 1482 aa15.03■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.02■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 POTEJP0CG39 1038 aa15.02■□□□□ -0
CS-217ENST00000550044 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.02□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.02□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 MED14O60244 1454 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 NCOA2Q15596 1464 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 MAP3K1Q13233 1512 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 NLRP1Q9C000 1473 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 KIF3BO15066 747 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 MIA2Q96PC5 1412 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-217ENST00000550044 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 POTEAQ6S8J7 498 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 MBD5Q9P267 1494 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-217ENST00000550044 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 TSPY4P0CV99 314 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 TSPY10P0CW01 314 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 KIF12Q96FN5 646 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 ERVK-7P63135 1459 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 ABCC3O15438 1527 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-217ENST00000550044 PLEKHG5O94827 1062 aa14.83□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 CEP152O94986 1710 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 SEC24BO95487 1268 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 LTKP29376 864 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 TIE1P35590 1138 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 SLIT1O75093 1534 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 TMEM94Q12767 1356 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 PHLPP1O60346 1717 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.77□□□□□ -0.04
CS-217ENST00000550044 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 POTEFA5A3E0 1075 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 ABCC5O15440 1437 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 MAP3K13O43283 966 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 EID1Q9Y6B2 187 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 PIK3C2BO00750 1634 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 TRIM52Q96A61 297 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 DAPK1P53355 1430 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 JCADQ9P266 1359 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 TRPC6Q9Y210 931 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 ITGAEP38570 1179 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CS-217ENST00000550044 LRP6O75581 1613 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 KCNA6P17658 529 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 MSH6P52701 1360 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 NWD1Q149M9 1564 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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