RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CS-217ENST00000550044 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.36■■■□□ 2.29
CS-217ENST00000550044 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CS-217ENST00000550044 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CS-217ENST00000550044 FOXD1Q16676 465 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-217ENST00000550044 POTEDQ86YR6 584 aa24.17■■□□□ 1.46
CS-217ENST00000550044 MSH5O43196 834 aa23.8■■□□□ 1.4
CS-217ENST00000550044 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-217ENST00000550044 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CS-217ENST00000550044 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-217ENST00000550044 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.87■■□□□ 1.25
CS-217ENST00000550044 ADRA2BP18089 450 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-217ENST00000550044 ABCC9O60706 1549 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-217ENST00000550044 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-217ENST00000550044 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.17■□□□□ 0.98
CS-217ENST00000550044 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CS-217ENST00000550044 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CS-217ENST00000550044 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21■□□□□ 0.95
CS-217ENST00000550044 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CS-217ENST00000550044 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-217ENST00000550044 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-217ENST00000550044 NACADO15069 1562 aa20.33■□□□□ 0.84
CS-217ENST00000550044 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
CS-217ENST00000550044 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-217ENST00000550044 RNF39Q9H2S5 420 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-217ENST00000550044 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.14■□□□□ 0.81
CS-217ENST00000550044 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CS-217ENST00000550044 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-217ENST00000550044 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-217ENST00000550044 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CS-217ENST00000550044 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-217ENST00000550044 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CS-217ENST00000550044 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.83■□□□□ 0.77
CS-217ENST00000550044 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.8■□□□□ 0.76
CS-217ENST00000550044 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-217ENST00000550044 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-217ENST00000550044 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-217ENST00000550044 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CS-217ENST00000550044 SCRIBQ14160 1630 aa19.52■□□□□ 0.72
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CS-217ENST00000550044 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-217ENST00000550044 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.686e-9■□□□□ 10
CS-217ENST00000550044 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
CS-217ENST00000550044 CUX2O14529 1486 aa19.09■□□□□ 0.65
CS-217ENST00000550044 ERCC6Q03468 1493 aa18.99■□□□□ 0.63
CS-217ENST00000550044 POTEHQ6S545 545 aa18.87■□□□□ 0.61
CS-217ENST00000550044 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
CS-217ENST00000550044 NCAPD3P42695 1498 aa18.75■□□□□ 0.59
CS-217ENST00000550044 CAPN15O75808 1086 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-217ENST00000550044 NESP48681 1621 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-217ENST00000550044 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-217ENST00000550044 DSG3P32926 999 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-217ENST00000550044 TRIM41Q8WV44 630 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-217ENST00000550044 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-217ENST00000550044 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CS-217ENST00000550044 HMGXB3Q12766 1538 aa18.6■□□□□ 0.57
CS-217ENST00000550044 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CS-217ENST00000550044 SMARCA2P51531 1590 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-217ENST00000550044 SMARCA4P51532 1647 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-217ENST00000550044 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.47■□□□□ 0.55
CS-217ENST00000550044 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CS-217ENST00000550044 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.46■□□□□ 0.55
CS-217ENST00000550044 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-217ENST00000550044 APLP2Q06481 763 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-217ENST00000550044 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CS-217ENST00000550044 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-217ENST00000550044 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CS-217ENST00000550044 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-217ENST00000550044 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CS-217ENST00000550044 WDR62O43379 1518 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-217ENST00000550044 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.17■□□□□ 0.5
CS-217ENST00000550044 ABCB7O75027 752 aa18.17■□□□□ 0.5
CS-217ENST00000550044 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.17■□□□□ 0.5
CS-217ENST00000550044 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CS-217ENST00000550044 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CS-217ENST00000550044 OSCARQ8IYS5 282 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-217ENST00000550044 SLC4A2P04920 1241 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-217ENST00000550044 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-217ENST00000550044 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-217ENST00000550044 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-217ENST00000550044 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-217ENST00000550044 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18■□□□□ 0.47
CS-217ENST00000550044 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CS-217ENST00000550044 WIZO95785 1651 aa17.96■□□□□ 0.47
CS-217ENST00000550044 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CS-217ENST00000550044 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CS-217ENST00000550044 ARHGEF11O15085 1522 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-217ENST00000550044 KCNA4P22459 653 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-217ENST00000550044 CFTRP13569 1480 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-217ENST00000550044 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
CS-217ENST00000550044 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-217ENST00000550044 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.73■□□□□ 0.43
CS-217ENST00000550044 PRDM2Q13029 1718 aa17.71■□□□□ 0.43
CS-217ENST00000550044 IFT140Q96RY7 1462 aa17.7■□□□□ 0.42
CS-217ENST00000550044 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CS-217ENST00000550044 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CS-217ENST00000550044 ARAP1Q96P48 1450 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-217ENST00000550044 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CS-217ENST00000550044 CHD1O14646 1710 aa17.66■□□□□ 0.42
CS-217ENST00000550044 POLA2Q14181 598 aa17.6■□□□□ 0.41
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