RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.68□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 TIAM1Q13009 1591 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 KIF3BO15066 747 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 CLCN6P51797 869 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 TNRQ92752 1358 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.67□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.64□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.64□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.64□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.64□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 TOM1O60784 492 aa7.64□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.63□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.63□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.63□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.63□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.63□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 CPS1P31327 1500 aa7.62□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 PZPP20742 1482 aa7.62□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.62□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 MBD5Q9P267 1494 aa7.62□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 EVX2Q03828 476 aa7.62□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.62□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 ALKQ9UM73 1620 aa7.61□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.61□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.61□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 IQGAP1P46940 1657 aa7.6□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 KIF12Q96FN5 646 aa7.6□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 NCOA2Q15596 1464 aa7.6□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 MIA2Q96PC5 1412 aa7.6□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.59□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.59□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.59□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 CEP162Q5TB80 1403 aa7.59□□□□□ -1.19
TMLHE-202ENST00000369439 NLRP1Q9C000 1473 aa7.58□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 PYGBP11216 843 aa7.58□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 PHF12Q96QT6 1004 aa7.58□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 CEP152O94986 1710 aa7.58□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 ABCC3O15438 1527 aa7.57□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.57□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 ERVK-7P63135 1459 aa7.56□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 TSPY4P0CV99 314 aa7.56□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 TSPY10P0CW01 314 aa7.56□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 HOMEZQ8IX15 550 aa7.56□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 DEPDC5O75140 1603 aa7.56□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 SYNMO15061 1565 aa7.55□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 MAP3K13O43283 966 aa7.55□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.55□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 MED14O60244 1454 aa7.55□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.54□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.53□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.53□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 LTKP29376 864 aa7.53□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.53□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.53□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TMLHE-202ENST00000369439 GABBR2O75899 941 aa7.52□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 POTEAQ6S8J7 498 aa7.51□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 IFNL1Q8IU54 200 aa7.51□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.51□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.51□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 PIK3C2BO00750 1634 aa7.51□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM94Q12767 1356 aa7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 KIF15Q9NS87 1388 aa7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 EID1Q9Y6B2 187 aa7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 MAST1Q9Y2H9 1570 aa7.5□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.49□□□□□ -1.21
TMLHE-202ENST00000369439 C14orf37Q86TY3 774 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms