RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 NLRP13Q86W25 1043 aa25.77■■□□□ 1.72
ZNF554-201ENST00000317243 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.77■■□□□ 1.72
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ZNF554-201ENST00000317243 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.76■■□□□ 1.71
ZNF554-201ENST00000317243 CEP152O94986 1710 aa25.76■■□□□ 1.71
ZNF554-201ENST00000317243 GGT6Q6P531 493 aa25.76■■□□□ 1.71
ZNF554-201ENST00000317243 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.75■■□□□ 1.71
ZNF554-201ENST00000317243 LAMC1P11047 1609 aa25.75■■□□□ 1.71
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ZNF554-201ENST00000317243 TET3O43151 1660 aa25.75■■□□□ 1.71
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ZNF554-201ENST00000317243 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
ZNF554-201ENST00000317243 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.74■■□□□ 1.71
ZNF554-201ENST00000317243 RAPGEF3O95398 923 aa25.72■■□□□ 1.71
ZNF554-201ENST00000317243 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.71■■□□□ 1.71
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ZNF554-201ENST00000317243 IQGAP1P46940 1657 aa25.69■■□□□ 1.7
ZNF554-201ENST00000317243 CD109Q6YHK3 1445 aa25.68■■□□□ 1.7
ZNF554-201ENST00000317243 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
ZNF554-201ENST00000317243 MROH2AA6NES4 1674 aa25.65■■□□□ 1.7
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ZNF554-201ENST00000317243 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.61■■□□□ 1.69
ZNF554-201ENST00000317243 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.6■■□□□ 1.69
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ZNF554-201ENST00000317243 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.59■■□□□ 1.69
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ZNF554-201ENST00000317243 NOS1P29475 1434 aa25.57■■□□□ 1.68
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ZNF554-201ENST00000317243 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.56■■□□□ 1.68
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ZNF554-201ENST00000317243 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.56■■□□□ 1.68
ZNF554-201ENST00000317243 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.56■■□□□ 1.68
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ZNF554-201ENST00000317243 PLIN1O60240 522 aa25.56■■□□□ 1.68
ZNF554-201ENST00000317243 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.56■■□□□ 1.68
ZNF554-201ENST00000317243 KIF1BO60333 1816 aa25.55■■□□□ 1.68
ZNF554-201ENST00000317243 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.54■■□□□ 1.68
ZNF554-201ENST00000317243 MYOM1P52179 1685 aa25.54■■□□□ 1.68
ZNF554-201ENST00000317243 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.51■■□□□ 1.67
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ZNF554-201ENST00000317243 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.5■■□□□ 1.67
ZNF554-201ENST00000317243 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.5■■□□□ 1.67
ZNF554-201ENST00000317243 ERVK-7P63135 1459 aa25.49■■□□□ 1.67
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ZNF554-201ENST00000317243 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.43■■□□□ 1.66
ZNF554-201ENST00000317243 CDCA8Q53HL2 280 aa25.43■■□□□ 1.66
ZNF554-201ENST00000317243 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.43■■□□□ 1.66
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ZNF554-201ENST00000317243 ADGRB3O60242 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
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ZNF554-201ENST00000317243 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.41■■□□□ 1.66
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ZNF554-201ENST00000317243 STK26Q9P289 416 aa25.33■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 CRBNQ96SW2 442 aa25.32■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.32■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 APAF1O14727 1248 aa25.32■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.32■■□□□ 1.64
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