RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 KIF3BO15066 747 aa22.11■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.1■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.09■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 MPNDQ8N594 471 aa22.09■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.09■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.08■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 ESPNB1AK53 854 aa22.08■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 PDE3AQ14432 1141 aa22.07■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 SOX12O15370 315 aa22.07■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 MTHFSP49914 203 aa22.07■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 GGT6Q6P531 493 aa22.07■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.07■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.06■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 ROCK1Q13464 1354 aa22.05■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 WWC1Q8IX03 1113 aa22.05■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 ERBINQ96RT1 1412 aa22.04■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 PLEKHG5O94827 1062 aa22.04■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 MCTP1Q6DN14 999 aa22.03■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.03■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.03■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 RUNDC1Q96C34 613 aa22.03■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.03■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 RNF214Q8ND24 703 aa22.03■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 ZMYND15Q9H091 742 aa22.02■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.02■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 CASC1Q6TDU7 716 aa22.02■■□□□ 1.12
SIRT1-201ENST00000212015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.02■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.01■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.01■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 KDM6BO15054 1643 aa22■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.99■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 GRIN2BQ13224 1484 aa21.99■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.99■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.98■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.98■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.98■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.97■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.97■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 RLBP1P12271 317 aa21.96■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
SIRT1-201ENST00000212015 RIPK4P57078 832 aa21.95■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.95■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.95■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.93■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 TESK2Q96S53 571 aa21.93■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 HECW1Q76N89 1606 aa21.91■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.91■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.91■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 PTPRGP23470 1445 aa21.9■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.9■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 AFAP1Q8N556 730 aa21.9■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.89■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SIRT1-201ENST00000212015 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 HMOX1P09601 288 aa21.88■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.87■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 CABP2Q9NPB3 220 aa21.86■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 KANK1Q14678 1352 aa21.86■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.86■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.85■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 CUL7Q14999 1698 aa21.85■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.85■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 SSFA2P28290 1259 aa21.85■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.85■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 PZPP20742 1482 aa21.84■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 PTMSP20962 102 aa21.84■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 CLCN1P35523 988 aa21.83■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 IQGAP2Q13576 1575 aa21.83■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.83■■□□□ 1.09
SIRT1-201ENST00000212015 ST18O60284 1047 aa21.82■■□□□ 1.08
SIRT1-201ENST00000212015 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SIRT1-201ENST00000212015 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.82■■□□□ 1.08
SIRT1-201ENST00000212015 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SIRT1-201ENST00000212015 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.82■■□□□ 1.08
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