RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ttll13A4Q9F6 804 aa29.8■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fam184bQ0KK56 942 aa29.8■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pola1P33609 1465 aa29.8■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CrbnQ8C7D2 445 aa29.78■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ak9G3UYQ4 1894 aa29.78■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ShprhQ7TPQ3 1674 aa29.77■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AnkarA2RT91 1465 aa29.76■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abcc6Q9R1S7 1498 aa29.75■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kdm2aP59997 1161 aa29.75■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abca8bQ8K440 1620 aa29.74■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rwdd1Q9CQK7 243 aa29.73■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Erich6D3Z6S9 713 aa29.72■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29.72■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plekhh1Q80TI1 1356 aa29.71■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abca17E9PX95 1733 aa29.7■■■□□ 2.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Uggt2E9Q4X2 1504 aa29.7■■■□□ 2.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29.7■■■□□ 2.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Iqcf3Q9D498 203 aa29.69■■■□□ 2.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ChgaP26339 463 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sall3Q62255 1320 aa29.66■■■□□ 2.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kidins220E9Q9B7 1793 aa29.65■■■□□ 2.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa29.63■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Col17a1Q07563 1470 aa29.62■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abcc1O35379 1528 aa29.62■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm20521D3Z5F7 333 aa29.61■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zmym3Q9JLM4 1370 aa29.61■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 B4galnt3Q6L8S8 986 aa29.6■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 EspnQ9ET47 871 aa29.6■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif7B7ZNG0 1348 aa29.59■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Os9Q8K2C7 672 aa29.59■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa29.58■■■□□ 2.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Stard8Q8K031 1019 aa29.57■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa29.57■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chd1P40201 1711 aa29.56■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nkx1-2P42580 305 aa29.55■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Usp19Q3UJD6 1360 aa29.55■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nlrp6Q91WS2 869 aa29.55■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc30Q8BVF4 654 aa29.54■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa29.52■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif3bQ61771 747 aa29.52■■■□□ 2.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chmp5Q9D7S9 219 aa29.51■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Myo5cE9Q1F5 1742 aa29.51■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ttc21bQ0HA38 1315 aa29.51■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ErbinQ80TH2 1402 aa29.51■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Usp40Q8BWR4 1235 aa29.5■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dcaf11Q91VU6 549 aa29.49■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Igf1rQ60751 1373 aa29.49■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Znf608Q56A10 1511 aa29.48■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Apbb1Q9QXJ1 710 aa29.48■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dbr1Q923B1 550 aa29.48■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nos1Q9Z0J4 1429 aa29.47■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CanxP35564 591 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nphp4P59240 1425 aa29.46■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Neurod2Q62414 383 aa29.46■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zfyve16Q80U44 1528 aa29.45■■■□□ 2.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NudcO35685 332 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Golga2Q921M4 999 aa29.45■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Stk24Q99KH8 431 aa29.45■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa29.45■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fan1Q69ZT1 1020 aa29.44■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa29.44■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa29.43■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rims1Q99NE5 1463 aa29.42■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Iqgap3F8VQ29 1632 aa29.41■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Myo3aQ8K3H5 1613 aa29.41■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PrkcshO08795 521 aa29.41■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fndc1E9Q043 1732 aa29.41■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ralbp1Q62172 648 aa29.4■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Uspl1Q3ULM6 1089 aa29.39■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa29.39■■■□□ 2.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AatkQ80YE4 1365 aa29.37■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abca6Q8K441 1624 aa29.37■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abca8aQ8K442 1620 aa29.37■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dnai1Q8C0M8 701 aa29.37■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppm1gQ61074 542 aa29.35■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Talpid3E9PV87 1520 aa29.34■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lemd3Q9WU40 921 aa29.34■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa29.32■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 DnmbpQ6TXD4 1580 aa29.31■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abca9Q8K449 1623 aa29.31■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mre11Q61216 706 aa29.31■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tspyl2Q7TQI8 677 aa29.3■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 DaxxO35613 739 aa29.28■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa29.27■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 KdrP35918 1367 aa29.27■■■□□ 2.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Myom2Q14BI5 1463 aa29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.9 ms