RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C LSB5P25369 354 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C UTR5P32630 166 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C FLO10P36170 1169 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C IKI1P38874 309 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C PHM8P40025 321 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YIL060WP40519 144 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C MRPL22P53881 309 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C DPB4Q04603 196 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C ASM4Q05166 528 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C GPN3Q06543 272 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C MCH1Q07376 486 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YOR292CQ08743 309 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YOS1Q3E834 85 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YLR365WQ7LIF2 110 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C ODC2Q99297 307 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C GAL1P04385 528 aa5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C URA6P15700 204 aa5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C SRY1P36007 326 aa5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YBR197CP38306 217 aa5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C RTT105P40063 208 aa5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C GPP2P40106 250 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YHP1Q04116 353 aa5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C MRPL35Q06678 367 aa5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C ATG41Q12048 136 aa5.48□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C SSO2P39926 295 aa5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C VHT1P53241 593 aa5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C RSM27P53305 110 aa5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C CAB4P53332 305 aa5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C TDA1Q03533 586 aa5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C LPP1Q04396 274 aa5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C SWT1Q12104 458 aa5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa5.47□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C TDH1P00360 332 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C STF2P16965 84 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YMR31P19955 123 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C AUA1P32450 94 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RIB7P33312 244 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YKR045CP36138 183 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C SDH4P37298 181 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C FMP23P38231 175 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C FCY21P40039 528 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YJL163CP46996 555 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C ERG25P53045 309 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C ALG9P53868 555 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YLR281CQ05863 155 aa5.46□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C CDC34P14682 295 aa5.45□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C MDM10P18409 493 aa5.45□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C ROX3P25046 220 aa5.45□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C OTU1P43558 301 aa5.45□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YDR179W-AQ03983 463 aa5.45□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C PCL7P40186 285 aa5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RFC2P40348 353 aa5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C TOS8P53147 276 aa5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C CWC25P53854 179 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C HED1Q03937 162 aa5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C AEP3Q12089 606 aa5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C INP53Q12271 1107 aa5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C BOL1Q3E793 110 aa5.44□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C COX2P00410 251 aa5.43□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C CKA1P15790 372 aa5.43□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C SEN2P16658 377 aa5.43□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C SEC66P33754 206 aa5.43□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YGR042WP53227 271 aa5.43□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C KEI1Q06346 221 aa5.43□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C NDE2Q07500 545 aa5.43□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RPL3P14126 387 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C MED8P38304 223 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C GEP4P38812 185 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C POP2P39008 433 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C COX15P40086 486 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YNL194CP40169 301 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C SYG1P40528 902 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C ATG18P43601 500 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C ECM27P47144 725 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C ACT1P60010 375 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C HRD1Q08109 551 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C GEP3Q08622 556 aa5.42□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C VPS63O13549 108 aa5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C HTB1P02293 131 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C GRX2P17695 143 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C ERV1P27882 189 aa5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C HOM6P31116 359 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C HYM1P32464 399 aa5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data5.41□□□□□ -1.54not detected
SPE3YPR069C GVP36P40531 326 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RBL2P48606 106 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YGR219WP53307 113 aa5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C CAB5Q03941 241 aa5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms