RNA–Protein interactions for RNA: YJL069C

UTP18, Transcript of Small-subunit processome protein involved in pre-18S rRNA maturation, yeastyeast

Gene UTP18, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UTP18YJL069C YAL064W-BO13512 126 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SCO1P23833 295 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ERG4P25340 473 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C TRR1P29509 319 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SRB6P32570 121 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C PMT3P47190 753 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YGR066CP53242 292 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YGR126WP53274 230 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YML018CQ03730 393 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C VAM3Q12241 283 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C MCT1Q12283 360 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa4.83□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C COX1P00401 534 aa4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YHR214C-DP0CX93 97 aa4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C FRS1P15624 595 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C VMA5P31412 392 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C MCM10P32354 571 aa4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C INN1P53901 409 aa4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C VBA4Q04602 768 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C CTS2Q06350 511 aa4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C HEM25Q07534 307 aa4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SCP1Q08873 200 aa4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C FYV7Q12247 151 aa4.82□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SPS4P09937 338 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C PDX1P16451 410 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C LDS1P31379 325 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C AFG1P32317 509 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C FMT1P32785 401 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YBR096WP38256 230 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YHR210CP38893 341 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C BUD8P41698 603 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C CUP9P41817 306 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C NIT2P47016 307 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C NIF3P53081 288 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C HHO1P53551 258 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ALG9P53868 555 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YDR248CQ03786 193 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C CAB5Q03941 241 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YDR387CQ04162 555 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SYM1Q06563 197 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C GRE1Q08969 168 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YPL272CQ08984 517 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C TFC7Q12415 435 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ERG3P32353 365 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C TCA17P32613 152 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C EMP24P32803 203 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C GSP1P32835 219 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C GSP2P32836 220 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C REC104P33323 182 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SPC29P33419 253 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SHO1P40073 367 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YER158CP40095 573 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C RFC2P40348 353 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C BUL1P48524 976 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C PDR16P53860 351 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C RNH201P53942 307 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ACT1P60010 375 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C RSM23Q01163 450 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YDC1Q02896 317 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data4.81□□□□□ -1.64not detected
UTP18YJL069C SWM1Q12379 170 aa4.81□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ZRC1P20107 442 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ARO4P32449 370 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C POP8P38208 133 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SHG1P38337 142 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YIR035CP40579 254 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C REE1P40893 198 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C GPP1P41277 250 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C PHO23P50947 330 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C UFD1P53044 361 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C PNC1P53184 216 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YDL086WQ07505 273 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C RFU1Q08003 200 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ZEO1Q08245 113 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C FRE7Q12333 620 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C EAF3Q12432 401 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C POL2P21951 2222 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C YPT1P01123 206 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SGA1P08019 549 aa4.79□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C SEC22P22214 214 aa4.79□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C RFA1P22336 621 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UTP18YJL069C ERG8P24521 451 aa4.79□□□□□ -1.64
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