Protein–RNA interactions for Protein: Q12690

RPL13A, 60S ribosomal protein L13-A, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL13AQ12690 NSR1YGR159C 1245 nt16.96■□□□□ 0.31
RPL13AQ12690 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.62■□□□□ 0.25
RPL13AQ12690 NOP1YDL014W 984 nt16.06■□□□□ 0.16
RPL13AQ12690 MDJ1YFL016C 1536 nt15.41■□□□□ 0.06
RPL13AQ12690 YJL027CYJL027C 417 nt14.29□□□□□ -0.12
RPL13AQ12690 YKL036CYKL036C 393 nt14.29□□□□□ -0.12
RPL13AQ12690 SRX1YKL086W 384 nt13.94□□□□□ -0.18
RPL13AQ12690 Q0297Q0297 156 nt13.79□□□□□ -0.2
RPL13AQ12690 DBP2YNL112W 1641 nt13.37□□□□□ -0.27
RPL13AQ12690 YBR190WYBR190W 312 nt13.35□□□□□ -0.27
RPL13AQ12690 YCR051WYCR051W 669 nt13.22□□□□□ -0.29
RPL13AQ12690 RTC3YHR087W 336 nt13.08□□□□□ -0.32
RPL13AQ12690 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13AQ12690 CCC1YLR220W 969 nt12.76□□□□□ -0.37
RPL13AQ12690 RVS167YDR388W 1449 nt12.71□□□□□ -0.38
RPL13AQ12690 SSA3YBL075C 1950 nt12.69□□□□□ -0.38
RPL13AQ12690 SCS3YGL126W 1143 nt12.68□□□□□ -0.38
RPL13AQ12690 RPP1BYDL130W 321 nt12.39□□□□□ -0.43
RPL13AQ12690 PUT4YOR348C 1884 nt12.38□□□□□ -0.43
RPL13AQ12690 YOL085CYOL085C 342 nt12.34□□□□□ -0.43
RPL13AQ12690 SCJ1YMR214W 1134 nt12.31□□□□□ -0.44
RPL13AQ12690 PKP1YIL042C 1185 nt12.2□□□□□ -0.46
RPL13AQ12690 SHR5YOL110W 714 nt12.06□□□□□ -0.48
RPL13AQ12690 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.01□□□□□ -0.49
RPL13AQ12690 POA1YBR022W 534 nt12.01□□□□□ -0.49
RPL13AQ12690 ARE1YCR048W 1833 nt12.01□□□□□ -0.49
RPL13AQ12690 URN1YPR152C 1398 nt12□□□□□ -0.49
RPL13AQ12690 SAH1YER043C 1350 nt11.93□□□□□ -0.5
RPL13AQ12690 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.92□□□□□ -0.5
RPL13AQ12690 OPI9YLR338W 858 nt11.92□□□□□ -0.5
RPL13AQ12690 PET122YER153C 765 nt11.84□□□□□ -0.51
RPL13AQ12690 RPN10YHR200W 807 nt11.84□□□□□ -0.51
RPL13AQ12690 DEP1YAL013W 1218 nt11.83□□□□□ -0.52
RPL13AQ12690 BSC6YOL137W 1494 nt11.83□□□□□ -0.52
RPL13AQ12690 SCR1SCR1 522 nt11.74□□□□□ -0.53
RPL13AQ12690 YNL208WYNL208W 600 nt11.67□□□□□ -0.54
RPL13AQ12690 BUD23YCR047C 828 nt11.66□□□□□ -0.54
RPL13AQ12690 YDJ1YNL064C 1230 nt11.65□□□□□ -0.54
RPL13AQ12690 PUN1YLR414C 792 nt11.63□□□□□ -0.55
RPL13AQ12690 PTC2YER089C 1395 nt11.53□□□□□ -0.56
RPL13AQ12690 RRN5YLR141W 1092 nt11.48□□□□□ -0.57
RPL13AQ12690 GAR1YHR089C 618 nt11.47□□□□□ -0.57
RPL13AQ12690 NAB2YGL122C 1578 nt11.46□□□□□ -0.57
RPL13AQ12690 SPT5YML010W 3192 nt11.45□□□□□ -0.58
RPL13AQ12690 YJR018WYJR018W 363 nt11.44□□□□□ -0.58
RPL13AQ12690 SSA4YER103W 1929 nt11.39□□□□□ -0.59
RPL13AQ12690 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.23□□□□□ -0.61
RPL13AQ12690 ATS1YAL020C 1002 nt11.22□□□□□ -0.61
RPL13AQ12690 FPR4YLR449W 1179 nt11.22□□□□□ -0.61
RPL13AQ12690 DAL1YIR027C 1383 nt11.21□□□□□ -0.61
RPL13AQ12690 RPP2BYDR382W 333 nt11.18□□□□□ -0.62
RPL13AQ12690 MEP2YNL142W 1500 nt11.15□□□□□ -0.62
RPL13AQ12690 RSB1YOR049C 1065 nt11.15□□□□□ -0.62
RPL13AQ12690 INM2YDR287W 879 nt11.14□□□□□ -0.63
RPL13AQ12690 FIS1YIL065C 468 nt11.14□□□□□ -0.63
RPL13AQ12690 TIR1YER011W 765 nt11.1□□□□□ -0.63
RPL13AQ12690 PHO4YFR034C 939 nt11.07□□□□□ -0.64
RPL13AQ12690 YPS1YLR120C 1710 nt11.01□□□□□ -0.65
RPL13AQ12690 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11□□□□□ -0.65
RPL13AQ12690 SSA1YAL005C 1929 nt10.98□□□□□ -0.65
RPL13AQ12690 YJR120WYJR120W 351 nt10.98□□□□□ -0.65
RPL13AQ12690 YMR090WYMR090W 684 nt10.94□□□□□ -0.66
RPL13AQ12690 BDF1YLR399C 2061 nt10.94□□□□□ -0.66
RPL13AQ12690 YBL100CYBL100C 315 nt10.92□□□□□ -0.66
RPL13AQ12690 DCW1YKL046C 1350 nt10.9□□□□□ -0.66
RPL13AQ12690 YDR095CYDR095C 411 nt10.87□□□□□ -0.67
RPL13AQ12690 EMI2YDR516C 1503 nt10.83□□□□□ -0.68
RPL13AQ12690 TAT1YBR069C 1860 nt10.81□□□□□ -0.68
RPL13AQ12690 ALF1YNL148C 765 nt10.8□□□□□ -0.68
RPL13AQ12690 BDH2YAL061W 1254 nt10.77□□□□□ -0.69
RPL13AQ12690 PAC11YDR488C 1602 nt10.76□□□□□ -0.69
RPL13AQ12690 FUN26YAL022C 1554 nt10.74□□□□□ -0.69
RPL13AQ12690 YBR220CYBR220C 1683 nt10.73□□□□□ -0.69
RPL13AQ12690 TRM9YML014W 840 nt10.71□□□□□ -0.69
RPL13AQ12690 YDL221WYDL221W 552 nt10.7□□□□□ -0.7
RPL13AQ12690 RPP2AYOL039W 321 nt10.7□□□□□ -0.7
RPL13AQ12690 SDH1YKL148C 1923 nt10.64□□□□□ -0.71
RPL13AQ12690 NVJ2YPR091C 2313 nt10.61□□□□□ -0.71
RPL13AQ12690 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RPL13AQ12690 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RPL13AQ12690 CAC2YML102W 1407 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL13AQ12690 PTP1YDL230W 1008 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL13AQ12690 SRB2YHR041C 633 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL13AQ12690 LSM3YLR438C-A 270 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL13AQ12690 YJL225CYJL225C 5277 nt10.57□□□□□ -0.72
RPL13AQ12690 CCT6YDR188W 1641 nt10.55□□□□□ -0.72
RPL13AQ12690 SEC11YIR022W 504 nt10.55□□□□□ -0.72
RPL13AQ12690 SCC4YER147C 1875 nt10.54□□□□□ -0.72
RPL13AQ12690 SIS1YNL007C 1059 nt10.52□□□□□ -0.73
RPL13AQ12690 WWM1YFL010C 636 nt10.48□□□□□ -0.73
RPL13AQ12690 PCH2YBR186W 1695 nt10.47□□□□□ -0.73
RPL13AQ12690 PST2YDR032C 597 nt10.45□□□□□ -0.74
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