RNA–Protein interactions for RNA: YHL029C

OCA5, Transcript of Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus, yeast

Gene OCA5, Length 2,040 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OCA5	YHL029C	TAE1	P38340	232 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	SHO1	P40073	367 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	STE24	P47154	453 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	EST3	Q03096	181 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	FRE7	Q12333	620 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	UTR2	P32623	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	ATF1	P40353	525 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	COX18	P53239	316 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	RTT102	P53330	157 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	HHT1	P61830	136 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	UBX3	Q12229	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	HKR1	P41809	1802 aa		4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	CBP4	P37267	147 aa		4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	HSP10	P38910	106 aa		4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	TGL5	Q12043	749 aa		4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	LAS17	Q12446	633 aa		4.65	□□□□□ -1.66
OCA5	YHL029C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MSN1	P22148	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SLY41	P22215	453 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MIG1	P27705	504 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PPA2	P28239	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ATS1	P31386	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	HOG1	P32485	435 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
OCA5	YHL029C	SKN1	P33336	771 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YHR130C	P38834	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CTF8	P38877	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PEX7	P39108	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YPS6	P40583	537 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	POP1	P41812	875 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YIP4	P53093	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SGF73	P53165	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	LST7	P53237	242 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MRPL19	P53875	158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	NSG2	P53898	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SUR7	P54003	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	THI74	Q04083	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	AGE1	Q04412	482 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	IRC13	Q08630	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SDH2	P21801	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PCL1	P24867	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PAU16	P35994	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	LDH1	P38139	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PAU24	P38155	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	UBS1	P38290	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TRR2	P38816	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YJL068C	P40363	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	NAS2	P40555	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YGL235W	P53071	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PDR17	P53844	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CAB5	Q03941	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	DPP1	Q05521	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	GRE1	Q08969	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MCP1	Q12106	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ERV2	Q12284	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ORT1	Q12375	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PCL9	Q12477	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	THI80	P35202	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SAF1	P38352	637 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SRP14	P38985	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ACA1	P39970	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PRM5	P40476	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YIL060W	P40519	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TTI2	P47168	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PAU12	P53343	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ARA2	Q04212	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	IZH2	Q12442	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	VAR1	P02381	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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