Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 NSR1YGR159C 1245 nt17.94■□□□□ 0.46
TIR4Q12218 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.64■□□□□ 0.41
TIR4Q12218 NOP1YDL014W 984 nt16.94■□□□□ 0.3
TIR4Q12218 MDJ1YFL016C 1536 nt16.35■□□□□ 0.21
TIR4Q12218 YKL036CYKL036C 393 nt15.26■□□□□ 0.03
TIR4Q12218 YJL027CYJL027C 417 nt15□□□□□ -0.01
TIR4Q12218 SRX1YKL086W 384 nt14.85□□□□□ -0.03
TIR4Q12218 Q0297Q0297 156 nt14.75□□□□□ -0.05
TIR4Q12218 DBP2YNL112W 1641 nt14.34□□□□□ -0.11
TIR4Q12218 YBR190WYBR190W 312 nt14.05□□□□□ -0.16
TIR4Q12218 YCR051WYCR051W 669 nt14□□□□□ -0.17
TIR4Q12218 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.72□□□□□ -0.21
TIR4Q12218 SCS3YGL126W 1143 nt13.69□□□□□ -0.22
TIR4Q12218 RTC3YHR087W 336 nt13.64□□□□□ -0.23
TIR4Q12218 CCC1YLR220W 969 nt13.49□□□□□ -0.25
TIR4Q12218 SSA3YBL075C 1950 nt13.34□□□□□ -0.27
TIR4Q12218 RVS167YDR388W 1449 nt13.27□□□□□ -0.29
TIR4Q12218 YOL085CYOL085C 342 nt13.26□□□□□ -0.29
TIR4Q12218 SCJ1YMR214W 1134 nt13.23□□□□□ -0.29
TIR4Q12218 RPP1BYDL130W 321 nt13.22□□□□□ -0.29
TIR4Q12218 PUT4YOR348C 1884 nt13.14□□□□□ -0.31
TIR4Q12218 PKP1YIL042C 1185 nt13.08□□□□□ -0.32
TIR4Q12218 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.81□□□□□ -0.36
TIR4Q12218 ARE1YCR048W 1833 nt12.76□□□□□ -0.37
TIR4Q12218 SHR5YOL110W 714 nt12.76□□□□□ -0.37
TIR4Q12218 PET122YER153C 765 nt12.71□□□□□ -0.37
TIR4Q12218 URN1YPR152C 1398 nt12.67□□□□□ -0.38
TIR4Q12218 POA1YBR022W 534 nt12.64□□□□□ -0.39
TIR4Q12218 SAH1YER043C 1350 nt12.61□□□□□ -0.39
TIR4Q12218 OPI9YLR338W 858 nt12.59□□□□□ -0.39
TIR4Q12218 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.57□□□□□ -0.4
TIR4Q12218 DEP1YAL013W 1218 nt12.52□□□□□ -0.41
TIR4Q12218 BSC6YOL137W 1494 nt12.48□□□□□ -0.41
TIR4Q12218 YDJ1YNL064C 1230 nt12.41□□□□□ -0.42
TIR4Q12218 SCR1SCR1 522 nt12.37□□□□□ -0.43
TIR4Q12218 RPN10YHR200W 807 nt12.33□□□□□ -0.44
TIR4Q12218 SPT5YML010W 3192 nt12.32□□□□□ -0.44
TIR4Q12218 YNL208WYNL208W 600 nt12.28□□□□□ -0.44
TIR4Q12218 RRN5YLR141W 1092 nt12.27□□□□□ -0.45
TIR4Q12218 PUN1YLR414C 792 nt12.2□□□□□ -0.46
TIR4Q12218 BUD23YCR047C 828 nt12.19□□□□□ -0.46
TIR4Q12218 GAR1YHR089C 618 nt12.16□□□□□ -0.46
TIR4Q12218 PTC2YER089C 1395 nt12.12□□□□□ -0.47
TIR4Q12218 ATS1YAL020C 1002 nt12.1□□□□□ -0.47
TIR4Q12218 YJR018WYJR018W 363 nt12.05□□□□□ -0.48
TIR4Q12218 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.03□□□□□ -0.48
TIR4Q12218 SSA4YER103W 1929 nt12.03□□□□□ -0.48
TIR4Q12218 NAB2YGL122C 1578 nt12.02□□□□□ -0.49
TIR4Q12218 FIS1YIL065C 468 nt11.89□□□□□ -0.51
TIR4Q12218 YJR120WYJR120W 351 nt11.88□□□□□ -0.51
TIR4Q12218 RSB1YOR049C 1065 nt11.85□□□□□ -0.51
TIR4Q12218 TIR1YER011W 765 nt11.79□□□□□ -0.52
TIR4Q12218 DAL1YIR027C 1383 nt11.79□□□□□ -0.52
TIR4Q12218 SSA1YAL005C 1929 nt11.77□□□□□ -0.53
TIR4Q12218 MEP2YNL142W 1500 nt11.76□□□□□ -0.53
TIR4Q12218 PHO4YFR034C 939 nt11.7□□□□□ -0.54
TIR4Q12218 FPR4YLR449W 1179 nt11.69□□□□□ -0.54
TIR4Q12218 INM2YDR287W 879 nt11.66□□□□□ -0.54
TIR4Q12218 YPS1YLR120C 1710 nt11.64□□□□□ -0.55
TIR4Q12218 RPP2BYDR382W 333 nt11.64□□□□□ -0.55
TIR4Q12218 BDF1YLR399C 2061 nt11.64□□□□□ -0.55
TIR4Q12218 DCW1YKL046C 1350 nt11.58□□□□□ -0.56
TIR4Q12218 SRB2YHR041C 633 nt11.55□□□□□ -0.56
TIR4Q12218 YDR095CYDR095C 411 nt11.51□□□□□ -0.57
TIR4Q12218 YBL100CYBL100C 315 nt11.49□□□□□ -0.57
TIR4Q12218 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.48□□□□□ -0.57
TIR4Q12218 TAT1YBR069C 1860 nt11.48□□□□□ -0.57
TIR4Q12218 EMI2YDR516C 1503 nt11.4□□□□□ -0.58
TIR4Q12218 BDH2YAL061W 1254 nt11.39□□□□□ -0.59
TIR4Q12218 YBR220CYBR220C 1683 nt11.36□□□□□ -0.59
TIR4Q12218 FUN26YAL022C 1554 nt11.36□□□□□ -0.59
TIR4Q12218 PTP1YDL230W 1008 nt11.33□□□□□ -0.6
TIR4Q12218 PST2YDR032C 597 nt11.31□□□□□ -0.6
TIR4Q12218 CAC2YML102W 1407 nt11.29□□□□□ -0.6
TIR4Q12218 YDL221WYDL221W 552 nt11.29□□□□□ -0.6
TIR4Q12218 YMR090WYMR090W 684 nt11.28□□□□□ -0.6
TIR4Q12218 RPP2AYOL039W 321 nt11.26□□□□□ -0.61
TIR4Q12218 SDH1YKL148C 1923 nt11.23□□□□□ -0.61
TIR4Q12218 ALF1YNL148C 765 nt11.23□□□□□ -0.61
TIR4Q12218 WWM1YFL010C 636 nt11.2□□□□□ -0.62
TIR4Q12218 TRM9YML014W 840 nt11.2□□□□□ -0.62
TIR4Q12218 CCT6YDR188W 1641 nt11.17□□□□□ -0.62
TIR4Q12218 LSM3YLR438C-A 270 nt11.15□□□□□ -0.62
TIR4Q12218 SIS1YNL007C 1059 nt11.15□□□□□ -0.62
TIR4Q12218 IRC15YPL017C 1500 nt11.14□□□□□ -0.63
TIR4Q12218 SCC4YER147C 1875 nt11.09□□□□□ -0.63
TIR4Q12218 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.05□□□□□ -0.64
TIR4Q12218 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.05□□□□□ -0.64
TIR4Q12218 GIS3YLR094C 1509 nt11.04□□□□□ -0.64
TIR4Q12218 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.03□□□□□ -0.64
TIR4Q12218 GFD2YCL036W 1701 nt11.02□□□□□ -0.65
TIR4Q12218 PCH2YBR186W 1695 nt11.01□□□□□ -0.65
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