RNA–Protein interactions for RNA: YJL113W

YJL113W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YJL113W, Length 4,647 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL113WYJL113W BUD25P85052 153 aa-0.53□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W FIT3Q08907 204 aa-0.53□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MCT1Q12283 360 aa-0.53□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W IZH2Q12442 317 aa-0.53□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa-0.53□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RIB3Q99258 208 aa-0.53□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CHO1P08456 276 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CLG1P35190 452 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W FCY21P40039 528 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SLZ1P40167 298 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W NAS2P40555 220 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YML6P51998 286 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YPS5P53057 165 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RCF2P53721 224 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MRPS12P53732 153 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CWC25P53854 179 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SUB1P54000 292 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SPO19Q03029 223 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YDR286CQ05530 114 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PEX27Q08580 376 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PSY3Q12318 242 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W HEM3P28789 327 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TIM12P32830 109 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MRPL6P32904 214 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPC25P35718 212 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SIT1P39980 628 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YGL204CP53089 101 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YGL108CP53139 140 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W FMP48P53233 369 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.54□□□□□ -2.5not detected
YJL113WYJL113W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PSK2Q08217 1101 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W IES3Q12345 250 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YOS9Q99220 542 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W COX9P07255 59 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RNA14P25298 677 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CPR4P25334 318 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YCR051WP25631 222 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W AIM10P39965 576 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SPO73P40031 143 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W URB2P47108 1174 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MDM34P53083 459 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W VPS20Q04272 221 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MED2Q12124 431 aa-0.54□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MDM35O60200 86 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RED1P14291 827 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W FBA1P14540 359 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PRE7P23724 241 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MEI4P29467 408 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MEI5P32489 222 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SSH1P38353 490 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YAR064WP39563 99 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W AYR1P40471 297 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W APQ12P40532 138 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SFH5P47008 294 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W BRP1P53194 125 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RIM9Q04734 239 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TRP1P00912 224 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPL39P04650 51 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CPA1P07258 411 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YCL042WP25572 119 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SBA1P28707 216 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W OAC1P32332 324 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PUP2P32379 260 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W GLC7P32598 312 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SLM1P40485 686 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SIP18P50263 79 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YGR164WP53291 111 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DAD3P69850 94 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W APL5Q08951 932 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YDL109CQ12103 647 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YPR063CQ12160 140 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TIM22Q12328 207 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W COA2Q3E823 68 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MSS18P08593 268 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YPR170W-BP0C5R9 85 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YLL053CP0CD98 152 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ZRC1P20107 442 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W HOG1P32485 435 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YKL100CP34248 587 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PHO89P38361 574 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RRF1P38771 230 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YGR269WP40326 108 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YJR142WP47173 342 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ARO8P53090 500 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YGR168CP53293 376 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YNR077CP53758 84 aa-0.55□□□□□ -2.5
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