RNA–Protein interactions for RNA: YNL077W

APJ1, Transcript of Chaperone with a role in SUMO-mediated protein degradation, yeast

Gene APJ1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APJ1	YNL077W	MET2	P08465	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	ENA1	P13587	1091 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	NDC1	P32500	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	APD1	P38281	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SHO1	P40073	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RRN9	P53437	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	BUD17	P53727	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SDC1	Q03323	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RNH1	Q04740	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MLC2	Q06580	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	IRC19	Q07843	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	GSH2	Q08220	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	HRT1	Q08273	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	VCX1	Q99385	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PHO80	P20052	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	ATS1	P31386	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
APJ1	YNL077W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
APJ1	YNL077W	YHR035W	P38769	630 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MDM31	P38880	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YEL057C	P39983	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	COS10	P52924	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YGR126W	P53274	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RSM28	Q03430	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SCS7	Q03529	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	ARP10	Q04549	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PCL9	Q12477	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PDX1	P16451	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YCL002C	P25565	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SUR1	P33300	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YIL169C	P40442	995 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	NAS2	P40555	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SSY5	P47002	699 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	NIT2	P47016	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	BUL1	P48524	976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	BRR6	P53062	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YGR066C	P53242	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MNT4	P53745	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	NUP49	Q02199	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SRL4	Q03085	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SPC19	Q03954	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	FLO9	P39712	1322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SEN2	P16658	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MDH2	P22133	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MAL32	P38158	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SHE1	P38200	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MLH1	P38920	769 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MAL12	P53341	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	GPI17	Q04080	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MCM21	Q06675	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	GRE1	Q08969	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SFG1	Q12507	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PDE2	P06776	526 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	STE12	P13574	688 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
APJ1	YNL077W	UTR1	P21373	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	ERG9	P29704	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	COS9	P36034	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	CHK1	P38147	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PHO90	P39535	881 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	BUR6	P40096	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	HIS6	P40545	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MNN5	P46982	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SFH5	P47008	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YJL055W	P47044	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	EFM3	P47163	339 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	FDC1	Q03034	503 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	FMP42	Q04991	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.6 ms