RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	SEC62	P21825	274 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PET18	P25362	215 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PAU3	P25610	124 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PHO11	P35842	467 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	ADD66	P36040	267 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YBL028C	P38202	106 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	VID24	P38263	362 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PHO12	P38693	467 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	BNS1	P50084	137 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MGA1	P53050	456 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	FIT1	Q04433	528 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	RSF1	Q05043	376 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	IPK1	Q06667	281 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	BDS1	Q08347	646 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MET3	P08536	511 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YML003W	P0CF16	290 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY2A-C	P25383	438 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PRE4	P30657	266 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MRPL28	P36527	147 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PAU24	P38155	120 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	RRN10	P38204	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	CTF8	P38877	133 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	AXL2	P38928	823 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	UFE1	P41834	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MUP1	P50276	574 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	UFD1	P53044	361 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	CDD1	Q06549	142 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	IRC10	Q08118	586 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	SNF8	Q12483	233 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	DST1	P07273	309 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	SPS4	P09937	338 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	DAL3	P32459	195 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MRPS9	P38120	278 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	LDB7	P38210	180 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	REG2	P38232	338 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	RTC2	P38279	296 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PHO90	P39535	881 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YER010C	P40011	234 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MOB2	P43563	287 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	NPY1	P53164	384 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YGR066C	P53242	292 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	SHH3	Q04487	196 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YMR321C	Q04898	105 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PEX30	Q06169	523 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	AAD4	Q07747	329 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YPL272C	Q08984	517 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TMA17	Q12513	150 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YOR338W	Q99326	363 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	COX3	P00420	269 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MSK1	P32048	576 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MRPL4	P36517	319 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	CHS7	P38843	316 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	FLX1	P40464	311 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	GTS1	P40956	396 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	CAT5	P41735	233 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	MEP2	P41948	499 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YHC3	P47040	408 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YGL235W	P53071	178 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	SPC19	Q03954	165 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	SEN15	Q04675	128 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	SYM1	Q06563	197 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YOP1	Q12402	180 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	YLR358C	O13565	187 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	PHO2	P07269	559 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MTR4	YJL050W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9

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